Protein–RNA interactions for Protein: P61011

SRP54, Signal recognition particle 54 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54P61011 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRP54P61011 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRP54P61011 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRP54P61011 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRP54P61011 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SRP54P61011 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRP54P61011 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRP54P61011 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRP54P61011 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRP54P61011 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRP54P61011 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRP54P61011 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRP54P61011 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRP54P61011 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SRP54P61011 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRP54P61011 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRP54P61011 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRP54P61011 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRP54P61011 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRP54P61011 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SRP54P61011 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRP54P61011 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRP54P61011 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRP54P61011 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SRP54P61011 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SRP54P61011 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRP54P61011 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SRP54P61011 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SRP54P61011 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRP54P61011 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRP54P61011 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRP54P61011 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRP54P61011 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRP54P61011 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SRP54P61011 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRP54P61011 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRP54P61011 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRP54P61011 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRP54P61011 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRP54P61011 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRP54P61011 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SRP54P61011 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRP54P61011 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SRP54P61011 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRP54P61011 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SRP54P61011 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRP54P61011 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRP54P61011 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRP54P61011 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRP54P61011 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRP54P61011 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SRP54P61011 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRP54P61011 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRP54P61011 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRP54P61011 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRP54P61011 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SRP54P61011 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRP54P61011 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SRP54P61011 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SRP54P61011 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRP54P61011 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRP54P61011 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRP54P61011 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SRP54P61011 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SRP54P61011 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRP54P61011 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRP54P61011 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRP54P61011 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRP54P61011 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRP54P61011 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SRP54P61011 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRP54P61011 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRP54P61011 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRP54P61011 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRP54P61011 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRP54P61011 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRP54P61011 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRP54P61011 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRP54P61011 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRP54P61011 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRP54P61011 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRP54P61011 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRP54P61011 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SRP54P61011 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRP54P61011 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRP54P61011 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRP54P61011 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRP54P61011 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRP54P61011 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRP54P61011 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRP54P61011 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRP54P61011 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRP54P61011 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRP54P61011 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRP54P61011 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRP54P61011 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRP54P61011 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRP54P61011 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRP54P61011 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SRP54P61011 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms