Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms