Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVFRD-1P60508 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVFRD-1P60508 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVFRD-1P60508 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVFRD-1P60508 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVFRD-1P60508 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVFRD-1P60508 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVFRD-1P60508 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVFRD-1P60508 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVFRD-1P60508 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVFRD-1P60508 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVFRD-1P60508 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVFRD-1P60508 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVFRD-1P60508 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVFRD-1P60508 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVFRD-1P60508 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVFRD-1P60508 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVFRD-1P60508 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVFRD-1P60508 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVFRD-1P60508 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVFRD-1P60508 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVFRD-1P60508 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVFRD-1P60508 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVFRD-1P60508 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVFRD-1P60508 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVFRD-1P60508 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVFRD-1P60508 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVFRD-1P60508 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVFRD-1P60508 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVFRD-1P60508 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVFRD-1P60508 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVFRD-1P60508 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVFRD-1P60508 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVFRD-1P60508 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVFRD-1P60508 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVFRD-1P60508 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVFRD-1P60508 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVFRD-1P60508 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVFRD-1P60508 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVFRD-1P60508 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVFRD-1P60508 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVFRD-1P60508 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVFRD-1P60508 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVFRD-1P60508 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVFRD-1P60508 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVFRD-1P60508 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVFRD-1P60508 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVFRD-1P60508 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVFRD-1P60508 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVFRD-1P60508 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVFRD-1P60508 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVFRD-1P60508 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVFRD-1P60508 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVFRD-1P60508 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVFRD-1P60508 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVFRD-1P60508 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVFRD-1P60508 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVFRD-1P60508 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVFRD-1P60508 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVFRD-1P60508 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVFRD-1P60508 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVFRD-1P60508 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVFRD-1P60508 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ERVFRD-1P60508 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVFRD-1P60508 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVFRD-1P60508 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVFRD-1P60508 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVFRD-1P60508 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVFRD-1P60508 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVFRD-1P60508 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVFRD-1P60508 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVFRD-1P60508 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVFRD-1P60508 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVFRD-1P60508 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVFRD-1P60508 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVFRD-1P60508 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVFRD-1P60508 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVFRD-1P60508 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVFRD-1P60508 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVFRD-1P60508 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVFRD-1P60508 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVFRD-1P60508 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVFRD-1P60508 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVFRD-1P60508 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVFRD-1P60508 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVFRD-1P60508 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVFRD-1P60508 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVFRD-1P60508 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVFRD-1P60508 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVFRD-1P60508 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVFRD-1P60508 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVFRD-1P60508 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVFRD-1P60508 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVFRD-1P60508 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVFRD-1P60508 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVFRD-1P60508 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVFRD-1P60508 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVFRD-1P60508 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVFRD-1P60508 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVFRD-1P60508 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms