Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP107P57740 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP107P57740 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP107P57740 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP107P57740 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP107P57740 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP107P57740 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP107P57740 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP107P57740 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP107P57740 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP107P57740 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP107P57740 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP107P57740 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP107P57740 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP107P57740 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP107P57740 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP107P57740 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP107P57740 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP107P57740 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP107P57740 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP107P57740 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP107P57740 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP107P57740 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP107P57740 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP107P57740 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP107P57740 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP107P57740 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP107P57740 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP107P57740 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP107P57740 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP107P57740 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP107P57740 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP107P57740 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP107P57740 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP107P57740 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP107P57740 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP107P57740 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP107P57740 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP107P57740 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP107P57740 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP107P57740 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP107P57740 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP107P57740 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUP107P57740 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP107P57740 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP107P57740 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP107P57740 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP107P57740 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP107P57740 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP107P57740 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP107P57740 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP107P57740 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP107P57740 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP107P57740 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP107P57740 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP107P57740 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP107P57740 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP107P57740 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP107P57740 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP107P57740 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP107P57740 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP107P57740 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP107P57740 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP107P57740 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP107P57740 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP107P57740 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP107P57740 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP107P57740 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP107P57740 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP107P57740 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP107P57740 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP107P57740 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP107P57740 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP107P57740 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
NUP107P57740 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
NUP107P57740 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP107P57740 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP107P57740 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP107P57740 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP107P57740 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP107P57740 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP107P57740 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP107P57740 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP107P57740 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP107P57740 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP107P57740 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP107P57740 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP107P57740 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP107P57740 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP107P57740 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP107P57740 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP107P57740 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP107P57740 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP107P57740 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP107P57740 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP107P57740 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP107P57740 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP107P57740 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP107P57740 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP107P57740 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms