Protein–RNA interactions for Protein: P55055

NR1H2, Oxysterols receptor LXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H2P55055 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR1H2P55055 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR1H2P55055 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR1H2P55055 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR1H2P55055 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR1H2P55055 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR1H2P55055 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR1H2P55055 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR1H2P55055 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR1H2P55055 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR1H2P55055 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR1H2P55055 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NR1H2P55055 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR1H2P55055 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR1H2P55055 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR1H2P55055 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR1H2P55055 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR1H2P55055 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NR1H2P55055 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR1H2P55055 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR1H2P55055 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR1H2P55055 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR1H2P55055 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR1H2P55055 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NR1H2P55055 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NR1H2P55055 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NR1H2P55055 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NR1H2P55055 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NR1H2P55055 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NR1H2P55055 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR1H2P55055 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR1H2P55055 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR1H2P55055 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR1H2P55055 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR1H2P55055 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR1H2P55055 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR1H2P55055 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR1H2P55055 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR1H2P55055 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR1H2P55055 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR1H2P55055 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR1H2P55055 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR1H2P55055 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR1H2P55055 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR1H2P55055 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR1H2P55055 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR1H2P55055 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR1H2P55055 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR1H2P55055 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR1H2P55055 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR1H2P55055 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NR1H2P55055 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR1H2P55055 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR1H2P55055 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR1H2P55055 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR1H2P55055 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR1H2P55055 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR1H2P55055 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR1H2P55055 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR1H2P55055 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR1H2P55055 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR1H2P55055 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NR1H2P55055 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NR1H2P55055 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NR1H2P55055 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NR1H2P55055 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NR1H2P55055 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NR1H2P55055 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR1H2P55055 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR1H2P55055 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR1H2P55055 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR1H2P55055 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NR1H2P55055 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR1H2P55055 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR1H2P55055 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR1H2P55055 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR1H2P55055 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR1H2P55055 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR1H2P55055 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR1H2P55055 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1H2P55055 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1H2P55055 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1H2P55055 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1H2P55055 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1H2P55055 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1H2P55055 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1H2P55055 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR1H2P55055 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NR1H2P55055 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR1H2P55055 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NR1H2P55055 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR1H2P55055 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1H2P55055 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1H2P55055 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1H2P55055 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1H2P55055 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1H2P55055 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1H2P55055 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1H2P55055 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1H2P55055 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118 ms