Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GPC3P51654 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GPC3P51654 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GPC3P51654 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GPC3P51654 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GPC3P51654 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GPC3P51654 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GPC3P51654 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GPC3P51654 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GPC3P51654 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
GPC3P51654 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GPC3P51654 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GPC3P51654 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GPC3P51654 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GPC3P51654 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GPC3P51654 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GPC3P51654 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GPC3P51654 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GPC3P51654 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GPC3P51654 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPC3P51654 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPC3P51654 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GPC3P51654 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPC3P51654 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPC3P51654 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPC3P51654 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPC3P51654 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPC3P51654 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GPC3P51654 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GPC3P51654 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GPC3P51654 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GPC3P51654 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GPC3P51654 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
GPC3P51654 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GPC3P51654 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
GPC3P51654 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GPC3P51654 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GPC3P51654 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GPC3P51654 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GPC3P51654 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GPC3P51654 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPC3P51654 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPC3P51654 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPC3P51654 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GPC3P51654 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GPC3P51654 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GPC3P51654 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GPC3P51654 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GPC3P51654 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GPC3P51654 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GPC3P51654 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GPC3P51654 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GPC3P51654 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GPC3P51654 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GPC3P51654 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GPC3P51654 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GPC3P51654 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GPC3P51654 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GPC3P51654 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
GPC3P51654 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
GPC3P51654 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GPC3P51654 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GPC3P51654 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GPC3P51654 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPC3P51654 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPC3P51654 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPC3P51654 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
GPC3P51654 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPC3P51654 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GPC3P51654 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GPC3P51654 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GPC3P51654 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GPC3P51654 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GPC3P51654 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GPC3P51654 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GPC3P51654 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GPC3P51654 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GPC3P51654 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GPC3P51654 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GPC3P51654 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GPC3P51654 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GPC3P51654 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
GPC3P51654 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GPC3P51654 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GPC3P51654 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GPC3P51654 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
GPC3P51654 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
GPC3P51654 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
GPC3P51654 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GPC3P51654 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GPC3P51654 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GPC3P51654 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GPC3P51654 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GPC3P51654 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GPC3P51654 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GPC3P51654 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GPC3P51654 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GPC3P51654 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GPC3P51654 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
GPC3P51654 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms