Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERFP50548 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERFP50548 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERFP50548 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERFP50548 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERFP50548 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ERFP50548 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERFP50548 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERFP50548 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERFP50548 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERFP50548 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERFP50548 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERFP50548 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERFP50548 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERFP50548 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERFP50548 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERFP50548 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERFP50548 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERFP50548 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERFP50548 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERFP50548 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERFP50548 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERFP50548 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ERFP50548 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERFP50548 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERFP50548 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERFP50548 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ERFP50548 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERFP50548 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERFP50548 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERFP50548 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERFP50548 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERFP50548 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERFP50548 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERFP50548 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERFP50548 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERFP50548 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERFP50548 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERFP50548 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERFP50548 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERFP50548 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERFP50548 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERFP50548 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERFP50548 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERFP50548 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERFP50548 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERFP50548 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERFP50548 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERFP50548 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERFP50548 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERFP50548 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERFP50548 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERFP50548 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERFP50548 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERFP50548 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERFP50548 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERFP50548 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERFP50548 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ERFP50548 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ERFP50548 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ERFP50548 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERFP50548 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERFP50548 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERFP50548 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERFP50548 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERFP50548 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERFP50548 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERFP50548 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERFP50548 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERFP50548 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERFP50548 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERFP50548 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERFP50548 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERFP50548 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERFP50548 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERFP50548 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERFP50548 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERFP50548 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERFP50548 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERFP50548 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERFP50548 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERFP50548 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERFP50548 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERFP50548 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERFP50548 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ERFP50548 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERFP50548 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERFP50548 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERFP50548 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERFP50548 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERFP50548 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERFP50548 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERFP50548 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERFP50548 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERFP50548 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERFP50548 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERFP50548 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERFP50548 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERFP50548 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ERFP50548 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms