Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CSRP3P50461 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CSRP3P50461 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CSRP3P50461 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CSRP3P50461 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CSRP3P50461 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CSRP3P50461 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSRP3P50461 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSRP3P50461 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSRP3P50461 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSRP3P50461 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSRP3P50461 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CSRP3P50461 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSRP3P50461 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRP3P50461 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRP3P50461 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRP3P50461 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRP3P50461 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRP3P50461 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRP3P50461 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRP3P50461 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRP3P50461 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRP3P50461 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRP3P50461 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSRP3P50461 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CSRP3P50461 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSRP3P50461 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSRP3P50461 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSRP3P50461 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSRP3P50461 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSRP3P50461 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRP3P50461 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRP3P50461 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CSRP3P50461 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSRP3P50461 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSRP3P50461 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSRP3P50461 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CSRP3P50461 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CSRP3P50461 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSRP3P50461 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSRP3P50461 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSRP3P50461 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSRP3P50461 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSRP3P50461 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CSRP3P50461 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSRP3P50461 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSRP3P50461 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSRP3P50461 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSRP3P50461 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSRP3P50461 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSRP3P50461 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSRP3P50461 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRP3P50461 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRP3P50461 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRP3P50461 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRP3P50461 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRP3P50461 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRP3P50461 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRP3P50461 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRP3P50461 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRP3P50461 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRP3P50461 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRP3P50461 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRP3P50461 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRP3P50461 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRP3P50461 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRP3P50461 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSRP3P50461 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSRP3P50461 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSRP3P50461 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSRP3P50461 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSRP3P50461 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSRP3P50461 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSRP3P50461 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSRP3P50461 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSRP3P50461 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSRP3P50461 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSRP3P50461 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRP3P50461 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRP3P50461 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRP3P50461 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRP3P50461 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRP3P50461 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRP3P50461 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRP3P50461 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRP3P50461 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRP3P50461 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSRP3P50461 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSRP3P50461 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSRP3P50461 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSRP3P50461 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CSRP3P50461 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CSRP3P50461 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CSRP3P50461 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CSRP3P50461 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSRP3P50461 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSRP3P50461 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSRP3P50461 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSRP3P50461 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSRP3P50461 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms