Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CRIP1P50238 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRIP1P50238 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRIP1P50238 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRIP1P50238 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRIP1P50238 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CRIP1P50238 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRIP1P50238 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRIP1P50238 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRIP1P50238 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRIP1P50238 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CRIP1P50238 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRIP1P50238 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRIP1P50238 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRIP1P50238 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRIP1P50238 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRIP1P50238 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRIP1P50238 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRIP1P50238 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRIP1P50238 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRIP1P50238 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRIP1P50238 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRIP1P50238 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CRIP1P50238 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CRIP1P50238 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CRIP1P50238 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CRIP1P50238 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CRIP1P50238 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRIP1P50238 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CRIP1P50238 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRIP1P50238 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRIP1P50238 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRIP1P50238 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CRIP1P50238 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CRIP1P50238 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CRIP1P50238 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CRIP1P50238 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRIP1P50238 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRIP1P50238 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRIP1P50238 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRIP1P50238 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRIP1P50238 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRIP1P50238 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRIP1P50238 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRIP1P50238 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRIP1P50238 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRIP1P50238 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRIP1P50238 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRIP1P50238 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRIP1P50238 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRIP1P50238 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRIP1P50238 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRIP1P50238 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRIP1P50238 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRIP1P50238 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRIP1P50238 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRIP1P50238 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRIP1P50238 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRIP1P50238 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRIP1P50238 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRIP1P50238 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRIP1P50238 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRIP1P50238 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRIP1P50238 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CRIP1P50238 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRIP1P50238 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRIP1P50238 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRIP1P50238 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRIP1P50238 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CRIP1P50238 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRIP1P50238 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRIP1P50238 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRIP1P50238 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CRIP1P50238 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRIP1P50238 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRIP1P50238 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRIP1P50238 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRIP1P50238 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRIP1P50238 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRIP1P50238 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRIP1P50238 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRIP1P50238 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRIP1P50238 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRIP1P50238 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRIP1P50238 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRIP1P50238 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRIP1P50238 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CRIP1P50238 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRIP1P50238 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CRIP1P50238 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRIP1P50238 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRIP1P50238 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRIP1P50238 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRIP1P50238 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRIP1P50238 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRIP1P50238 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRIP1P50238 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRIP1P50238 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRIP1P50238 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRIP1P50238 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms