Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPAP49450 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CENPAP49450 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CENPAP49450 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPAP49450 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPAP49450 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPAP49450 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPAP49450 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPAP49450 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPAP49450 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPAP49450 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPAP49450 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPAP49450 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPAP49450 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPAP49450 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPAP49450 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPAP49450 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPAP49450 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPAP49450 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPAP49450 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPAP49450 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPAP49450 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPAP49450 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPAP49450 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPAP49450 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPAP49450 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPAP49450 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPAP49450 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPAP49450 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPAP49450 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPAP49450 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPAP49450 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPAP49450 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPAP49450 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPAP49450 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPAP49450 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPAP49450 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPAP49450 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPAP49450 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPAP49450 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPAP49450 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CENPAP49450 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CENPAP49450 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CENPAP49450 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPAP49450 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPAP49450 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPAP49450 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPAP49450 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPAP49450 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPAP49450 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPAP49450 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPAP49450 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPAP49450 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPAP49450 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPAP49450 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPAP49450 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPAP49450 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPAP49450 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPAP49450 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPAP49450 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPAP49450 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPAP49450 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPAP49450 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPAP49450 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPAP49450 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPAP49450 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPAP49450 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPAP49450 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPAP49450 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPAP49450 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPAP49450 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPAP49450 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPAP49450 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPAP49450 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPAP49450 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPAP49450 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPAP49450 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPAP49450 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPAP49450 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPAP49450 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPAP49450 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPAP49450 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPAP49450 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPAP49450 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPAP49450 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPAP49450 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPAP49450 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPAP49450 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPAP49450 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPAP49450 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPAP49450 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPAP49450 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPAP49450 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPAP49450 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPAP49450 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPAP49450 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPAP49450 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPAP49450 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPAP49450 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPAP49450 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms