Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
MCAMP43121 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
MCAMP43121 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
MCAMP43121 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
MCAMP43121 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
MCAMP43121 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
MCAMP43121 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
MCAMP43121 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
MCAMP43121 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
MCAMP43121 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
MCAMP43121 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
MCAMP43121 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
MCAMP43121 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
MCAMP43121 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
MCAMP43121 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
MCAMP43121 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
MCAMP43121 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
MCAMP43121 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
MCAMP43121 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
MCAMP43121 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
MCAMP43121 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
MCAMP43121 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
MCAMP43121 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
MCAMP43121 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
MCAMP43121 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MCAMP43121 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MCAMP43121 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
MCAMP43121 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.42
MCAMP43121 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
MCAMP43121 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
MCAMP43121 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
MCAMP43121 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
MCAMP43121 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
MCAMP43121 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
MCAMP43121 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
MCAMP43121 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
MCAMP43121 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MCAMP43121 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MCAMP43121 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
MCAMP43121 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MCAMP43121 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
MCAMP43121 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MCAMP43121 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
MCAMP43121 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MCAMP43121 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
MCAMP43121 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
MCAMP43121 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
MCAMP43121 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
MCAMP43121 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
MCAMP43121 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
MCAMP43121 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
MCAMP43121 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
MCAMP43121 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
MCAMP43121 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MCAMP43121 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MCAMP43121 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MCAMP43121 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
MCAMP43121 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
MCAMP43121 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MCAMP43121 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
MCAMP43121 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MCAMP43121 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
MCAMP43121 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MCAMP43121 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MCAMP43121 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MCAMP43121 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
MCAMP43121 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
MCAMP43121 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
MCAMP43121 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
MCAMP43121 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
MCAMP43121 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
MCAMP43121 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
MCAMP43121 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
MCAMP43121 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
MCAMP43121 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
MCAMP43121 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
MCAMP43121 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
MCAMP43121 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
MCAMP43121 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30■■■□□ 2.39
MCAMP43121 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
MCAMP43121 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MCAMP43121 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
MCAMP43121 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
MCAMP43121 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
MCAMP43121 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
MCAMP43121 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
MCAMP43121 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MCAMP43121 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
MCAMP43121 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
MCAMP43121 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MCAMP43121 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MCAMP43121 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
MCAMP43121 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
MCAMP43121 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
MCAMP43121 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MCAMP43121 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MCAMP43121 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MCAMP43121 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MCAMP43121 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
MCAMP43121 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 2895.4 ms