Protein–RNA interactions for Protein: P41250

GARS, Glycine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARSP41250 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GARSP41250 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GARSP41250 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GARSP41250 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GARSP41250 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GARSP41250 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GARSP41250 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GARSP41250 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GARSP41250 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GARSP41250 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GARSP41250 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
GARSP41250 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GARSP41250 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GARSP41250 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GARSP41250 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GARSP41250 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GARSP41250 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GARSP41250 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GARSP41250 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GARSP41250 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GARSP41250 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GARSP41250 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GARSP41250 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GARSP41250 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GARSP41250 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GARSP41250 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GARSP41250 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GARSP41250 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GARSP41250 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GARSP41250 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GARSP41250 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GARSP41250 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GARSP41250 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GARSP41250 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GARSP41250 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GARSP41250 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GARSP41250 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GARSP41250 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GARSP41250 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GARSP41250 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GARSP41250 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GARSP41250 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GARSP41250 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GARSP41250 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GARSP41250 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GARSP41250 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GARSP41250 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GARSP41250 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GARSP41250 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GARSP41250 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GARSP41250 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GARSP41250 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GARSP41250 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GARSP41250 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GARSP41250 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GARSP41250 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GARSP41250 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GARSP41250 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GARSP41250 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GARSP41250 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GARSP41250 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GARSP41250 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GARSP41250 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GARSP41250 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GARSP41250 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GARSP41250 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GARSP41250 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GARSP41250 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GARSP41250 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GARSP41250 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GARSP41250 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GARSP41250 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GARSP41250 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GARSP41250 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GARSP41250 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GARSP41250 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GARSP41250 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GARSP41250 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GARSP41250 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GARSP41250 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GARSP41250 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GARSP41250 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GARSP41250 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GARSP41250 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GARSP41250 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GARSP41250 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GARSP41250 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GARSP41250 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GARSP41250 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GARSP41250 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GARSP41250 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GARSP41250 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GARSP41250 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GARSP41250 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GARSP41250 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GARSP41250 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GARSP41250 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GARSP41250 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GARSP41250 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GARSP41250 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms