Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPARGP37231 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPARGP37231 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPARGP37231 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPARGP37231 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PPARGP37231 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPARGP37231 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPARGP37231 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPARGP37231 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPARGP37231 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPARGP37231 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPARGP37231 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPARGP37231 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPARGP37231 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPARGP37231 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPARGP37231 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPARGP37231 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPARGP37231 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PPARGP37231 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPARGP37231 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPARGP37231 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPARGP37231 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPARGP37231 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPARGP37231 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPARGP37231 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPARGP37231 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PPARGP37231 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PPARGP37231 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPARGP37231 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PPARGP37231 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPARGP37231 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPARGP37231 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPARGP37231 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPARGP37231 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPARGP37231 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPARGP37231 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PPARGP37231 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPARGP37231 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPARGP37231 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPARGP37231 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPARGP37231 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPARGP37231 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPARGP37231 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPARGP37231 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPARGP37231 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPARGP37231 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPARGP37231 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPARGP37231 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPARGP37231 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPARGP37231 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPARGP37231 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPARGP37231 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPARGP37231 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPARGP37231 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPARGP37231 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPARGP37231 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPARGP37231 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPARGP37231 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPARGP37231 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPARGP37231 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPARGP37231 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPARGP37231 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPARGP37231 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPARGP37231 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPARGP37231 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PPARGP37231 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPARGP37231 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPARGP37231 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPARGP37231 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPARGP37231 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPARGP37231 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPARGP37231 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPARGP37231 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPARGP37231 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PPARGP37231 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPARGP37231 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPARGP37231 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPARGP37231 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPARGP37231 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPARGP37231 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PPARGP37231 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PPARGP37231 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPARGP37231 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPARGP37231 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPARGP37231 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPARGP37231 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPARGP37231 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPARGP37231 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPARGP37231 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPARGP37231 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPARGP37231 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPARGP37231 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPARGP37231 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPARGP37231 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPARGP37231 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPARGP37231 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPARGP37231 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PPARGP37231 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPARGP37231 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPARGP37231 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms