Protein–RNA interactions for Protein: P32242

OTX1, Homeobox protein OTX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX1P32242 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTX1P32242 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTX1P32242 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTX1P32242 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTX1P32242 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTX1P32242 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTX1P32242 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTX1P32242 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTX1P32242 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTX1P32242 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTX1P32242 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTX1P32242 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTX1P32242 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTX1P32242 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTX1P32242 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTX1P32242 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
OTX1P32242 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTX1P32242 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTX1P32242 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTX1P32242 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTX1P32242 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTX1P32242 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
OTX1P32242 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
OTX1P32242 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTX1P32242 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTX1P32242 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTX1P32242 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTX1P32242 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTX1P32242 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTX1P32242 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTX1P32242 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTX1P32242 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTX1P32242 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTX1P32242 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTX1P32242 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTX1P32242 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTX1P32242 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTX1P32242 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTX1P32242 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTX1P32242 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTX1P32242 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTX1P32242 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTX1P32242 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTX1P32242 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
OTX1P32242 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTX1P32242 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTX1P32242 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTX1P32242 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTX1P32242 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTX1P32242 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTX1P32242 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTX1P32242 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTX1P32242 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTX1P32242 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTX1P32242 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
OTX1P32242 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTX1P32242 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTX1P32242 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTX1P32242 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTX1P32242 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTX1P32242 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTX1P32242 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTX1P32242 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTX1P32242 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTX1P32242 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTX1P32242 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTX1P32242 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTX1P32242 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTX1P32242 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTX1P32242 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
OTX1P32242 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTX1P32242 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTX1P32242 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTX1P32242 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTX1P32242 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTX1P32242 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTX1P32242 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTX1P32242 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTX1P32242 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTX1P32242 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
OTX1P32242 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
OTX1P32242 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
OTX1P32242 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTX1P32242 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTX1P32242 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTX1P32242 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTX1P32242 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTX1P32242 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTX1P32242 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTX1P32242 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTX1P32242 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTX1P32242 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTX1P32242 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
OTX1P32242 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
OTX1P32242 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTX1P32242 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTX1P32242 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTX1P32242 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTX1P32242 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTX1P32242 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms