Protein–RNA interactions for Protein: P31645

SLC6A4, Sodium-dependent serotonin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A4P31645 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC6A4P31645 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC6A4P31645 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC6A4P31645 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC6A4P31645 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC6A4P31645 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC6A4P31645 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC6A4P31645 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC6A4P31645 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC6A4P31645 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC6A4P31645 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC6A4P31645 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC6A4P31645 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC6A4P31645 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC6A4P31645 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC6A4P31645 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC6A4P31645 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC6A4P31645 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC6A4P31645 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC6A4P31645 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC6A4P31645 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC6A4P31645 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC6A4P31645 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC6A4P31645 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC6A4P31645 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC6A4P31645 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC6A4P31645 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC6A4P31645 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC6A4P31645 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC6A4P31645 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC6A4P31645 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC6A4P31645 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC6A4P31645 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC6A4P31645 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC6A4P31645 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC6A4P31645 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC6A4P31645 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC6A4P31645 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC6A4P31645 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC6A4P31645 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC6A4P31645 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC6A4P31645 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC6A4P31645 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC6A4P31645 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC6A4P31645 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC6A4P31645 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC6A4P31645 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC6A4P31645 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC6A4P31645 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC6A4P31645 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC6A4P31645 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC6A4P31645 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC6A4P31645 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC6A4P31645 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC6A4P31645 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC6A4P31645 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC6A4P31645 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC6A4P31645 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC6A4P31645 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC6A4P31645 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC6A4P31645 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC6A4P31645 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC6A4P31645 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC6A4P31645 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC6A4P31645 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC6A4P31645 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC6A4P31645 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC6A4P31645 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC6A4P31645 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC6A4P31645 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC6A4P31645 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC6A4P31645 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC6A4P31645 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC6A4P31645 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC6A4P31645 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC6A4P31645 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC6A4P31645 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC6A4P31645 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC6A4P31645 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC6A4P31645 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC6A4P31645 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC6A4P31645 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC6A4P31645 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC6A4P31645 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC6A4P31645 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC6A4P31645 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC6A4P31645 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC6A4P31645 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC6A4P31645 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC6A4P31645 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC6A4P31645 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC6A4P31645 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC6A4P31645 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC6A4P31645 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC6A4P31645 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC6A4P31645 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC6A4P31645 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC6A4P31645 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC6A4P31645 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC6A4P31645 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms