Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CPS1P31327 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CPS1P31327 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CPS1P31327 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CPS1P31327 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CPS1P31327 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
CPS1P31327 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
CPS1P31327 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CPS1P31327 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CPS1P31327 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CPS1P31327 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CPS1P31327 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CPS1P31327 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CPS1P31327 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CPS1P31327 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CPS1P31327 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CPS1P31327 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CPS1P31327 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CPS1P31327 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CPS1P31327 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CPS1P31327 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CPS1P31327 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
CPS1P31327 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
CPS1P31327 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.31
CPS1P31327 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
CPS1P31327 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CPS1P31327 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CPS1P31327 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CPS1P31327 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CPS1P31327 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CPS1P31327 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CPS1P31327 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CPS1P31327 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CPS1P31327 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
CPS1P31327 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CPS1P31327 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CPS1P31327 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CPS1P31327 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CPS1P31327 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CPS1P31327 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CPS1P31327 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CPS1P31327 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CPS1P31327 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
CPS1P31327 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CPS1P31327 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CPS1P31327 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CPS1P31327 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CPS1P31327 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CPS1P31327 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CPS1P31327 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CPS1P31327 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
CPS1P31327 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CPS1P31327 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CPS1P31327 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CPS1P31327 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CPS1P31327 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CPS1P31327 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CPS1P31327 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CPS1P31327 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CPS1P31327 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CPS1P31327 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CPS1P31327 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CPS1P31327 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CPS1P31327 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CPS1P31327 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CPS1P31327 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CPS1P31327 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CPS1P31327 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CPS1P31327 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CPS1P31327 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CPS1P31327 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CPS1P31327 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CPS1P31327 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CPS1P31327 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CPS1P31327 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CPS1P31327 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
CPS1P31327 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CPS1P31327 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CPS1P31327 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CPS1P31327 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CPS1P31327 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CPS1P31327 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CPS1P31327 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CPS1P31327 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CPS1P31327 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CPS1P31327 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CPS1P31327 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CPS1P31327 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CPS1P31327 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CPS1P31327 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CPS1P31327 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CPS1P31327 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
CPS1P31327 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
CPS1P31327 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
CPS1P31327 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CPS1P31327 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
CPS1P31327 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
CPS1P31327 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CPS1P31327 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
CPS1P31327 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms