Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HOXA7P31268 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HOXA7P31268 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HOXA7P31268 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HOXA7P31268 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HOXA7P31268 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HOXA7P31268 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
HOXA7P31268 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HOXA7P31268 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HOXA7P31268 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HOXA7P31268 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HOXA7P31268 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HOXA7P31268 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HOXA7P31268 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HOXA7P31268 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HOXA7P31268 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HOXA7P31268 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HOXA7P31268 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HOXA7P31268 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HOXA7P31268 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
HOXA7P31268 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HOXA7P31268 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HOXA7P31268 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
HOXA7P31268 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HOXA7P31268 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HOXA7P31268 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HOXA7P31268 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
HOXA7P31268 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HOXA7P31268 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HOXA7P31268 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HOXA7P31268 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HOXA7P31268 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HOXA7P31268 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HOXA7P31268 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HOXA7P31268 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
HOXA7P31268 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HOXA7P31268 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HOXA7P31268 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HOXA7P31268 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
HOXA7P31268 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HOXA7P31268 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HOXA7P31268 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HOXA7P31268 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HOXA7P31268 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
HOXA7P31268 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HOXA7P31268 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HOXA7P31268 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HOXA7P31268 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HOXA7P31268 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HOXA7P31268 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HOXA7P31268 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HOXA7P31268 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HOXA7P31268 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HOXA7P31268 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
HOXA7P31268 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
HOXA7P31268 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HOXA7P31268 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HOXA7P31268 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
HOXA7P31268 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
HOXA7P31268 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HOXA7P31268 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HOXA7P31268 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HOXA7P31268 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HOXA7P31268 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HOXA7P31268 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HOXA7P31268 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
HOXA7P31268 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HOXA7P31268 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HOXA7P31268 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HOXA7P31268 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HOXA7P31268 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HOXA7P31268 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HOXA7P31268 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HOXA7P31268 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HOXA7P31268 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HOXA7P31268 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
HOXA7P31268 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
HOXA7P31268 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HOXA7P31268 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HOXA7P31268 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HOXA7P31268 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HOXA7P31268 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HOXA7P31268 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HOXA7P31268 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HOXA7P31268 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
HOXA7P31268 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HOXA7P31268 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HOXA7P31268 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HOXA7P31268 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HOXA7P31268 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HOXA7P31268 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HOXA7P31268 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HOXA7P31268 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HOXA7P31268 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HOXA7P31268 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HOXA7P31268 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HOXA7P31268 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HOXA7P31268 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HOXA7P31268 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HOXA7P31268 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms