Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CCND3P30281 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCND3P30281 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCND3P30281 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCND3P30281 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCND3P30281 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCND3P30281 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCND3P30281 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CCND3P30281 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCND3P30281 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCND3P30281 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCND3P30281 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCND3P30281 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCND3P30281 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCND3P30281 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CCND3P30281 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCND3P30281 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CCND3P30281 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCND3P30281 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCND3P30281 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCND3P30281 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCND3P30281 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CCND3P30281 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCND3P30281 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCND3P30281 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCND3P30281 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCND3P30281 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCND3P30281 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCND3P30281 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCND3P30281 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCND3P30281 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CCND3P30281 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCND3P30281 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCND3P30281 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCND3P30281 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCND3P30281 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCND3P30281 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCND3P30281 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCND3P30281 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCND3P30281 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCND3P30281 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCND3P30281 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CCND3P30281 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCND3P30281 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCND3P30281 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCND3P30281 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCND3P30281 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCND3P30281 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCND3P30281 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCND3P30281 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCND3P30281 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCND3P30281 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCND3P30281 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCND3P30281 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCND3P30281 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCND3P30281 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCND3P30281 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CCND3P30281 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCND3P30281 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCND3P30281 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCND3P30281 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCND3P30281 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCND3P30281 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCND3P30281 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCND3P30281 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCND3P30281 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCND3P30281 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCND3P30281 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCND3P30281 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCND3P30281 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCND3P30281 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCND3P30281 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCND3P30281 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCND3P30281 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCND3P30281 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCND3P30281 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCND3P30281 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCND3P30281 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CCND3P30281 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCND3P30281 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCND3P30281 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CCND3P30281 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCND3P30281 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCND3P30281 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCND3P30281 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCND3P30281 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCND3P30281 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCND3P30281 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCND3P30281 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCND3P30281 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCND3P30281 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCND3P30281 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCND3P30281 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCND3P30281 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCND3P30281 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCND3P30281 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCND3P30281 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCND3P30281 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCND3P30281 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCND3P30281 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 199.9 ms