Protein–RNA interactions for Protein: P29320

EPHA3, Ephrin type-A receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA3P29320 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHA3P29320 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHA3P29320 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHA3P29320 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHA3P29320 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHA3P29320 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHA3P29320 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHA3P29320 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPHA3P29320 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPHA3P29320 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPHA3P29320 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPHA3P29320 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPHA3P29320 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPHA3P29320 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPHA3P29320 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHA3P29320 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHA3P29320 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHA3P29320 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPHA3P29320 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPHA3P29320 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHA3P29320 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHA3P29320 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHA3P29320 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHA3P29320 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHA3P29320 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHA3P29320 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHA3P29320 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHA3P29320 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHA3P29320 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHA3P29320 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHA3P29320 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHA3P29320 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHA3P29320 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHA3P29320 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHA3P29320 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHA3P29320 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHA3P29320 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHA3P29320 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHA3P29320 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHA3P29320 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHA3P29320 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHA3P29320 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHA3P29320 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHA3P29320 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHA3P29320 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
EPHA3P29320 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EPHA3P29320 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EPHA3P29320 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EPHA3P29320 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EPHA3P29320 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EPHA3P29320 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHA3P29320 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHA3P29320 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHA3P29320 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPHA3P29320 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPHA3P29320 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPHA3P29320 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPHA3P29320 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPHA3P29320 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPHA3P29320 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHA3P29320 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHA3P29320 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHA3P29320 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHA3P29320 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHA3P29320 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHA3P29320 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHA3P29320 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHA3P29320 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHA3P29320 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHA3P29320 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPHA3P29320 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPHA3P29320 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPHA3P29320 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPHA3P29320 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPHA3P29320 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPHA3P29320 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EPHA3P29320 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EPHA3P29320 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EPHA3P29320 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EPHA3P29320 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EPHA3P29320 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EPHA3P29320 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EPHA3P29320 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EPHA3P29320 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
EPHA3P29320 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
EPHA3P29320 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
EPHA3P29320 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EPHA3P29320 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EPHA3P29320 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EPHA3P29320 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EPHA3P29320 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EPHA3P29320 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EPHA3P29320 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EPHA3P29320 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EPHA3P29320 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EPHA3P29320 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EPHA3P29320 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EPHA3P29320 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EPHA3P29320 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EPHA3P29320 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms