Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
GTF2E1P29083 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
GTF2E1P29083 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
GTF2E1P29083 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
GTF2E1P29083 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
GTF2E1P29083 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
GTF2E1P29083 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
GTF2E1P29083 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
GTF2E1P29083 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
GTF2E1P29083 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GTF2E1P29083 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
GTF2E1P29083 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
GTF2E1P29083 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
GTF2E1P29083 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
GTF2E1P29083 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
GTF2E1P29083 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
GTF2E1P29083 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.59
GTF2E1P29083 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
GTF2E1P29083 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
GTF2E1P29083 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
GTF2E1P29083 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
GTF2E1P29083 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
GTF2E1P29083 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
GTF2E1P29083 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
GTF2E1P29083 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
GTF2E1P29083 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
GTF2E1P29083 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
GTF2E1P29083 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
GTF2E1P29083 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
GTF2E1P29083 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
GTF2E1P29083 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GTF2E1P29083 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC31.16■■■□□ 2.58
GTF2E1P29083 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
GTF2E1P29083 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
GTF2E1P29083 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
GTF2E1P29083 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
GTF2E1P29083 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
GTF2E1P29083 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
GTF2E1P29083 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
GTF2E1P29083 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
GTF2E1P29083 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
GTF2E1P29083 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
GTF2E1P29083 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
GTF2E1P29083 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
GTF2E1P29083 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
GTF2E1P29083 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
GTF2E1P29083 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
GTF2E1P29083 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GTF2E1P29083 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GTF2E1P29083 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GTF2E1P29083 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
GTF2E1P29083 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
GTF2E1P29083 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
GTF2E1P29083 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
GTF2E1P29083 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
GTF2E1P29083 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
GTF2E1P29083 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
GTF2E1P29083 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
GTF2E1P29083 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
GTF2E1P29083 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
GTF2E1P29083 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
GTF2E1P29083 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
GTF2E1P29083 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
GTF2E1P29083 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
GTF2E1P29083 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
GTF2E1P29083 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
GTF2E1P29083 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
GTF2E1P29083 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
GTF2E1P29083 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
GTF2E1P29083 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
GTF2E1P29083 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
GTF2E1P29083 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
GTF2E1P29083 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
GTF2E1P29083 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
GTF2E1P29083 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
GTF2E1P29083 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
GTF2E1P29083 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
GTF2E1P29083 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
GTF2E1P29083 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
GTF2E1P29083 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
GTF2E1P29083 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
GTF2E1P29083 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
GTF2E1P29083 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
GTF2E1P29083 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
GTF2E1P29083 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
GTF2E1P29083 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
GTF2E1P29083 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
GTF2E1P29083 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
GTF2E1P29083 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
GTF2E1P29083 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
GTF2E1P29083 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
GTF2E1P29083 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
GTF2E1P29083 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
GTF2E1P29083 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
GTF2E1P29083 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
GTF2E1P29083 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GTF2E1P29083 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GTF2E1P29083 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GTF2E1P29083 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
GTF2E1P29083 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms