Protein–RNA interactions for Protein: P28566

HTR1E, 5-hydroxytryptamine receptor 1E, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1EP28566 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTR1EP28566 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTR1EP28566 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTR1EP28566 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTR1EP28566 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTR1EP28566 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTR1EP28566 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HTR1EP28566 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HTR1EP28566 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HTR1EP28566 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HTR1EP28566 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HTR1EP28566 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTR1EP28566 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTR1EP28566 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTR1EP28566 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTR1EP28566 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTR1EP28566 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HTR1EP28566 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HTR1EP28566 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HTR1EP28566 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HTR1EP28566 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HTR1EP28566 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HTR1EP28566 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HTR1EP28566 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HTR1EP28566 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HTR1EP28566 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTR1EP28566 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTR1EP28566 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTR1EP28566 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTR1EP28566 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTR1EP28566 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTR1EP28566 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTR1EP28566 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTR1EP28566 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HTR1EP28566 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTR1EP28566 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTR1EP28566 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTR1EP28566 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTR1EP28566 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTR1EP28566 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTR1EP28566 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTR1EP28566 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTR1EP28566 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTR1EP28566 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HTR1EP28566 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTR1EP28566 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTR1EP28566 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HTR1EP28566 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTR1EP28566 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTR1EP28566 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTR1EP28566 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTR1EP28566 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTR1EP28566 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTR1EP28566 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTR1EP28566 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTR1EP28566 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTR1EP28566 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTR1EP28566 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTR1EP28566 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTR1EP28566 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTR1EP28566 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTR1EP28566 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTR1EP28566 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTR1EP28566 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTR1EP28566 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTR1EP28566 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTR1EP28566 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTR1EP28566 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTR1EP28566 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTR1EP28566 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTR1EP28566 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTR1EP28566 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTR1EP28566 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTR1EP28566 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTR1EP28566 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTR1EP28566 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTR1EP28566 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTR1EP28566 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTR1EP28566 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTR1EP28566 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTR1EP28566 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTR1EP28566 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTR1EP28566 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTR1EP28566 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTR1EP28566 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HTR1EP28566 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTR1EP28566 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTR1EP28566 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTR1EP28566 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HTR1EP28566 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTR1EP28566 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTR1EP28566 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTR1EP28566 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTR1EP28566 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTR1EP28566 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTR1EP28566 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTR1EP28566 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTR1EP28566 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTR1EP28566 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTR1EP28566 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms