Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
IL3RAP26951 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
IL3RAP26951 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IL3RAP26951 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IL3RAP26951 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
IL3RAP26951 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IL3RAP26951 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IL3RAP26951 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IL3RAP26951 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
IL3RAP26951 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
IL3RAP26951 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IL3RAP26951 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IL3RAP26951 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IL3RAP26951 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IL3RAP26951 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IL3RAP26951 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IL3RAP26951 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IL3RAP26951 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IL3RAP26951 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IL3RAP26951 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IL3RAP26951 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IL3RAP26951 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IL3RAP26951 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IL3RAP26951 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IL3RAP26951 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
IL3RAP26951 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IL3RAP26951 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IL3RAP26951 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IL3RAP26951 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IL3RAP26951 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
IL3RAP26951 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
IL3RAP26951 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IL3RAP26951 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IL3RAP26951 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IL3RAP26951 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IL3RAP26951 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IL3RAP26951 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IL3RAP26951 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IL3RAP26951 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IL3RAP26951 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IL3RAP26951 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IL3RAP26951 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IL3RAP26951 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IL3RAP26951 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IL3RAP26951 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IL3RAP26951 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IL3RAP26951 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IL3RAP26951 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IL3RAP26951 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
IL3RAP26951 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IL3RAP26951 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IL3RAP26951 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IL3RAP26951 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IL3RAP26951 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IL3RAP26951 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IL3RAP26951 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IL3RAP26951 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IL3RAP26951 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IL3RAP26951 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IL3RAP26951 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IL3RAP26951 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IL3RAP26951 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IL3RAP26951 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IL3RAP26951 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IL3RAP26951 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IL3RAP26951 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IL3RAP26951 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IL3RAP26951 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IL3RAP26951 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IL3RAP26951 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
IL3RAP26951 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IL3RAP26951 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IL3RAP26951 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IL3RAP26951 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IL3RAP26951 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IL3RAP26951 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IL3RAP26951 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IL3RAP26951 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IL3RAP26951 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IL3RAP26951 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IL3RAP26951 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IL3RAP26951 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IL3RAP26951 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IL3RAP26951 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IL3RAP26951 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IL3RAP26951 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IL3RAP26951 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IL3RAP26951 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IL3RAP26951 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
IL3RAP26951 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IL3RAP26951 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IL3RAP26951 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IL3RAP26951 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IL3RAP26951 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IL3RAP26951 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
IL3RAP26951 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IL3RAP26951 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IL3RAP26951 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IL3RAP26951 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IL3RAP26951 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms