Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
HMGB2P26583 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
HMGB2P26583 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
HMGB2P26583 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
HMGB2P26583 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
HMGB2P26583 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
HMGB2P26583 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
HMGB2P26583 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
HMGB2P26583 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
HMGB2P26583 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
HMGB2P26583 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
HMGB2P26583 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC32■■■□□ 2.71
HMGB2P26583 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
HMGB2P26583 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
HMGB2P26583 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
HMGB2P26583 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
HMGB2P26583 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
HMGB2P26583 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
HMGB2P26583 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
HMGB2P26583 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
HMGB2P26583 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
HMGB2P26583 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
HMGB2P26583 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
HMGB2P26583 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
HMGB2P26583 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
HMGB2P26583 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
HMGB2P26583 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
HMGB2P26583 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
HMGB2P26583 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
HMGB2P26583 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
HMGB2P26583 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
HMGB2P26583 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
HMGB2P26583 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
HMGB2P26583 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
HMGB2P26583 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
HMGB2P26583 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
HMGB2P26583 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
HMGB2P26583 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
HMGB2P26583 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
HMGB2P26583 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
HMGB2P26583 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
HMGB2P26583 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
HMGB2P26583 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
HMGB2P26583 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
HMGB2P26583 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
HMGB2P26583 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
HMGB2P26583 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
HMGB2P26583 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
HMGB2P26583 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
HMGB2P26583 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
HMGB2P26583 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
HMGB2P26583 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
HMGB2P26583 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
HMGB2P26583 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
HMGB2P26583 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
HMGB2P26583 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
HMGB2P26583 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC31.86■■■□□ 2.69
HMGB2P26583 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
HMGB2P26583 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
HMGB2P26583 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
HMGB2P26583 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
HMGB2P26583 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
HMGB2P26583 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
HMGB2P26583 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
HMGB2P26583 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
HMGB2P26583 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
HMGB2P26583 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
HMGB2P26583 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.68
HMGB2P26583 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
HMGB2P26583 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
HMGB2P26583 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
HMGB2P26583 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
HMGB2P26583 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
HMGB2P26583 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
HMGB2P26583 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
HMGB2P26583 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
HMGB2P26583 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
HMGB2P26583 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
HMGB2P26583 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
HMGB2P26583 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
HMGB2P26583 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
HMGB2P26583 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
HMGB2P26583 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
HMGB2P26583 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
HMGB2P26583 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
HMGB2P26583 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
HMGB2P26583 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
HMGB2P26583 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
HMGB2P26583 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
HMGB2P26583 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
HMGB2P26583 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
HMGB2P26583 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
HMGB2P26583 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
HMGB2P26583 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
HMGB2P26583 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
HMGB2P26583 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
HMGB2P26583 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
HMGB2P26583 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
HMGB2P26583 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
HMGB2P26583 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms