Protein–RNA interactions for Protein: P26373

RPL13, 60S ribosomal protein L13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13P26373 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPL13P26373 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RPL13P26373 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPL13P26373 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPL13P26373 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPL13P26373 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPL13P26373 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPL13P26373 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPL13P26373 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPL13P26373 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPL13P26373 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPL13P26373 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPL13P26373 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPL13P26373 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPL13P26373 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RPL13P26373 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPL13P26373 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPL13P26373 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPL13P26373 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPL13P26373 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPL13P26373 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPL13P26373 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPL13P26373 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPL13P26373 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPL13P26373 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPL13P26373 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPL13P26373 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPL13P26373 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPL13P26373 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RPL13P26373 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPL13P26373 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPL13P26373 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPL13P26373 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPL13P26373 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPL13P26373 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPL13P26373 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPL13P26373 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPL13P26373 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPL13P26373 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPL13P26373 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPL13P26373 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPL13P26373 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPL13P26373 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPL13P26373 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPL13P26373 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPL13P26373 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPL13P26373 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPL13P26373 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPL13P26373 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPL13P26373 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPL13P26373 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPL13P26373 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPL13P26373 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPL13P26373 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPL13P26373 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPL13P26373 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPL13P26373 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPL13P26373 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPL13P26373 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPL13P26373 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPL13P26373 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPL13P26373 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPL13P26373 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPL13P26373 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RPL13P26373 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
RPL13P26373 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RPL13P26373 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RPL13P26373 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RPL13P26373 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RPL13P26373 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPL13P26373 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPL13P26373 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPL13P26373 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPL13P26373 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPL13P26373 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RPL13P26373 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPL13P26373 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPL13P26373 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPL13P26373 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPL13P26373 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RPL13P26373 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPL13P26373 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPL13P26373 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RPL13P26373 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RPL13P26373 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RPL13P26373 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPL13P26373 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPL13P26373 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPL13P26373 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPL13P26373 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPL13P26373 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPL13P26373 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPL13P26373 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPL13P26373 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPL13P26373 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPL13P26373 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPL13P26373 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPL13P26373 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPL13P26373 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPL13P26373 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms