Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMO2P25791 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMO2P25791 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMO2P25791 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMO2P25791 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMO2P25791 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMO2P25791 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LMO2P25791 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMO2P25791 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMO2P25791 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMO2P25791 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMO2P25791 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMO2P25791 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMO2P25791 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMO2P25791 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMO2P25791 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMO2P25791 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMO2P25791 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMO2P25791 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMO2P25791 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMO2P25791 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMO2P25791 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMO2P25791 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMO2P25791 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMO2P25791 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMO2P25791 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
LMO2P25791 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMO2P25791 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMO2P25791 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMO2P25791 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMO2P25791 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMO2P25791 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMO2P25791 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMO2P25791 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
LMO2P25791 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMO2P25791 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMO2P25791 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMO2P25791 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMO2P25791 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
LMO2P25791 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
LMO2P25791 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMO2P25791 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LMO2P25791 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMO2P25791 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMO2P25791 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMO2P25791 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMO2P25791 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMO2P25791 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMO2P25791 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMO2P25791 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMO2P25791 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LMO2P25791 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMO2P25791 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMO2P25791 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMO2P25791 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMO2P25791 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMO2P25791 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMO2P25791 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMO2P25791 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMO2P25791 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMO2P25791 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMO2P25791 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMO2P25791 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMO2P25791 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMO2P25791 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMO2P25791 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMO2P25791 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMO2P25791 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMO2P25791 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMO2P25791 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMO2P25791 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMO2P25791 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMO2P25791 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMO2P25791 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMO2P25791 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMO2P25791 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMO2P25791 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
LMO2P25791 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMO2P25791 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMO2P25791 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMO2P25791 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMO2P25791 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMO2P25791 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMO2P25791 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LMO2P25791 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMO2P25791 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMO2P25791 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMO2P25791 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMO2P25791 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMO2P25791 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMO2P25791 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMO2P25791 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMO2P25791 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMO2P25791 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
LMO2P25791 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMO2P25791 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
LMO2P25791 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LMO2P25791 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LMO2P25791 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMO2P25791 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms