Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2CP19387 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2CP19387 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2CP19387 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2CP19387 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2CP19387 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2CP19387 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2CP19387 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2CP19387 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2CP19387 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR2CP19387 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR2CP19387 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR2CP19387 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR2CP19387 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2CP19387 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2CP19387 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2CP19387 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2CP19387 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2CP19387 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR2CP19387 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR2CP19387 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR2CP19387 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR2CP19387 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR2CP19387 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2CP19387 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2CP19387 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2CP19387 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR2CP19387 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR2CP19387 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR2CP19387 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR2CP19387 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR2CP19387 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR2CP19387 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR2CP19387 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR2CP19387 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR2CP19387 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR2CP19387 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR2CP19387 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR2CP19387 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR2CP19387 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR2CP19387 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR2CP19387 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR2CP19387 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
POLR2CP19387 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
POLR2CP19387 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
POLR2CP19387 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLR2CP19387 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLR2CP19387 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2CP19387 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2CP19387 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2CP19387 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2CP19387 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2CP19387 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2CP19387 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2CP19387 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2CP19387 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2CP19387 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2CP19387 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2CP19387 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2CP19387 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2CP19387 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2CP19387 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2CP19387 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR2CP19387 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR2CP19387 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR2CP19387 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR2CP19387 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR2CP19387 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR2CP19387 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR2CP19387 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR2CP19387 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR2CP19387 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR2CP19387 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR2CP19387 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR2CP19387 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR2CP19387 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR2CP19387 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR2CP19387 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR2CP19387 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR2CP19387 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR2CP19387 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR2CP19387 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR2CP19387 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR2CP19387 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR2CP19387 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR2CP19387 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR2CP19387 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR2CP19387 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR2CP19387 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR2CP19387 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR2CP19387 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR2CP19387 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR2CP19387 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR2CP19387 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR2CP19387 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR2CP19387 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR2CP19387 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR2CP19387 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR2CP19387 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR2CP19387 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms