Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARF4P18085 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARF4P18085 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ARF4P18085 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARF4P18085 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARF4P18085 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARF4P18085 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ARF4P18085 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARF4P18085 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARF4P18085 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARF4P18085 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARF4P18085 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARF4P18085 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARF4P18085 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARF4P18085 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARF4P18085 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARF4P18085 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARF4P18085 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARF4P18085 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARF4P18085 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARF4P18085 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARF4P18085 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARF4P18085 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARF4P18085 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARF4P18085 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARF4P18085 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARF4P18085 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARF4P18085 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARF4P18085 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARF4P18085 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARF4P18085 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARF4P18085 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARF4P18085 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARF4P18085 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARF4P18085 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARF4P18085 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARF4P18085 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARF4P18085 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARF4P18085 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARF4P18085 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARF4P18085 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ARF4P18085 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARF4P18085 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARF4P18085 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ARF4P18085 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARF4P18085 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ARF4P18085 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARF4P18085 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARF4P18085 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARF4P18085 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARF4P18085 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARF4P18085 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARF4P18085 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARF4P18085 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ARF4P18085 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ARF4P18085 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARF4P18085 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ARF4P18085 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARF4P18085 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARF4P18085 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARF4P18085 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARF4P18085 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARF4P18085 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARF4P18085 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARF4P18085 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARF4P18085 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ARF4P18085 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARF4P18085 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ARF4P18085 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ARF4P18085 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARF4P18085 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ARF4P18085 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARF4P18085 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARF4P18085 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ARF4P18085 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARF4P18085 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARF4P18085 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARF4P18085 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ARF4P18085 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARF4P18085 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARF4P18085 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARF4P18085 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARF4P18085 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARF4P18085 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARF4P18085 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARF4P18085 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ARF4P18085 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ARF4P18085 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARF4P18085 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARF4P18085 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ARF4P18085 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARF4P18085 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARF4P18085 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARF4P18085 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ARF4P18085 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARF4P18085 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ARF4P18085 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARF4P18085 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARF4P18085 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARF4P18085 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms