Protein–RNA interactions for Protein: P13591

NCAM1, Neural cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAM1P13591 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCAM1P13591 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCAM1P13591 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCAM1P13591 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCAM1P13591 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCAM1P13591 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCAM1P13591 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCAM1P13591 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCAM1P13591 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCAM1P13591 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCAM1P13591 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCAM1P13591 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCAM1P13591 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCAM1P13591 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCAM1P13591 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCAM1P13591 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCAM1P13591 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCAM1P13591 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCAM1P13591 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCAM1P13591 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCAM1P13591 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCAM1P13591 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCAM1P13591 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NCAM1P13591 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCAM1P13591 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCAM1P13591 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCAM1P13591 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NCAM1P13591 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCAM1P13591 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCAM1P13591 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NCAM1P13591 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NCAM1P13591 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NCAM1P13591 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NCAM1P13591 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NCAM1P13591 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCAM1P13591 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCAM1P13591 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCAM1P13591 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCAM1P13591 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCAM1P13591 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NCAM1P13591 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCAM1P13591 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NCAM1P13591 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCAM1P13591 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCAM1P13591 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCAM1P13591 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCAM1P13591 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCAM1P13591 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCAM1P13591 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCAM1P13591 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCAM1P13591 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCAM1P13591 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NCAM1P13591 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCAM1P13591 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCAM1P13591 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NCAM1P13591 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NCAM1P13591 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NCAM1P13591 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NCAM1P13591 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCAM1P13591 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCAM1P13591 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCAM1P13591 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCAM1P13591 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCAM1P13591 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCAM1P13591 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCAM1P13591 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NCAM1P13591 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCAM1P13591 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCAM1P13591 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCAM1P13591 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCAM1P13591 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCAM1P13591 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCAM1P13591 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NCAM1P13591 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCAM1P13591 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCAM1P13591 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCAM1P13591 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCAM1P13591 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCAM1P13591 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCAM1P13591 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCAM1P13591 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCAM1P13591 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCAM1P13591 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCAM1P13591 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NCAM1P13591 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCAM1P13591 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCAM1P13591 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCAM1P13591 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
NCAM1P13591 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCAM1P13591 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCAM1P13591 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCAM1P13591 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCAM1P13591 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCAM1P13591 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCAM1P13591 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCAM1P13591 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCAM1P13591 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCAM1P13591 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCAM1P13591 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCAM1P13591 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms