Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEFHP12036 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEFHP12036 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEFHP12036 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEFHP12036 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEFHP12036 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEFHP12036 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEFHP12036 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEFHP12036 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEFHP12036 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEFHP12036 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEFHP12036 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEFHP12036 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEFHP12036 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEFHP12036 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEFHP12036 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEFHP12036 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEFHP12036 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEFHP12036 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEFHP12036 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEFHP12036 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NEFHP12036 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEFHP12036 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEFHP12036 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEFHP12036 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEFHP12036 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFHP12036 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFHP12036 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFHP12036 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFHP12036 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEFHP12036 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEFHP12036 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEFHP12036 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEFHP12036 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NEFHP12036 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
NEFHP12036 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NEFHP12036 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEFHP12036 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEFHP12036 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEFHP12036 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NEFHP12036 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEFHP12036 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEFHP12036 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFHP12036 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NEFHP12036 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEFHP12036 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEFHP12036 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEFHP12036 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEFHP12036 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEFHP12036 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEFHP12036 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEFHP12036 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEFHP12036 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEFHP12036 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFHP12036 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFHP12036 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFHP12036 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFHP12036 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFHP12036 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFHP12036 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFHP12036 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFHP12036 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFHP12036 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEFHP12036 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEFHP12036 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEFHP12036 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEFHP12036 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEFHP12036 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NEFHP12036 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEFHP12036 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEFHP12036 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEFHP12036 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NEFHP12036 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEFHP12036 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEFHP12036 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEFHP12036 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEFHP12036 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEFHP12036 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEFHP12036 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEFHP12036 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEFHP12036 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEFHP12036 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEFHP12036 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEFHP12036 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEFHP12036 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEFHP12036 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEFHP12036 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEFHP12036 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NEFHP12036 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEFHP12036 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEFHP12036 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFHP12036 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFHP12036 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFHP12036 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFHP12036 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFHP12036 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFHP12036 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFHP12036 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFHP12036 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFHP12036 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms