Protein–RNA interactions for Protein: P08572

COL4A2, Collagen alpha-2(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A2P08572 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
COL4A2P08572 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL4A2P08572 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL4A2P08572 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
COL4A2P08572 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL4A2P08572 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A2P08572 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A2P08572 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A2P08572 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A2P08572 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A2P08572 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A2P08572 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL4A2P08572 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL4A2P08572 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL4A2P08572 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL4A2P08572 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL4A2P08572 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL4A2P08572 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL4A2P08572 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL4A2P08572 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL4A2P08572 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
COL4A2P08572 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL4A2P08572 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL4A2P08572 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL4A2P08572 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL4A2P08572 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL4A2P08572 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
COL4A2P08572 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
COL4A2P08572 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL4A2P08572 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL4A2P08572 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL4A2P08572 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
COL4A2P08572 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL4A2P08572 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL4A2P08572 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL4A2P08572 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL4A2P08572 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL4A2P08572 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A2P08572 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A2P08572 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A2P08572 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A2P08572 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL4A2P08572 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL4A2P08572 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL4A2P08572 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
COL4A2P08572 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL4A2P08572 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL4A2P08572 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL4A2P08572 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL4A2P08572 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
COL4A2P08572 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL4A2P08572 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL4A2P08572 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL4A2P08572 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
COL4A2P08572 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
COL4A2P08572 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL4A2P08572 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL4A2P08572 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL4A2P08572 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
COL4A2P08572 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL4A2P08572 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL4A2P08572 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL4A2P08572 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL4A2P08572 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
COL4A2P08572 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL4A2P08572 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL4A2P08572 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL4A2P08572 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL4A2P08572 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL4A2P08572 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL4A2P08572 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL4A2P08572 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL4A2P08572 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL4A2P08572 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL4A2P08572 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL4A2P08572 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL4A2P08572 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL4A2P08572 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
COL4A2P08572 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL4A2P08572 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL4A2P08572 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL4A2P08572 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL4A2P08572 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL4A2P08572 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
COL4A2P08572 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL4A2P08572 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL4A2P08572 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL4A2P08572 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL4A2P08572 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL4A2P08572 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL4A2P08572 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
COL4A2P08572 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL4A2P08572 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL4A2P08572 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL4A2P08572 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL4A2P08572 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL4A2P08572 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL4A2P08572 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL4A2P08572 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL4A2P08572 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms