Protein–RNA interactions for Protein: P05023

ATP1A1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A1P05023 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP1A1P05023 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP1A1P05023 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP1A1P05023 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP1A1P05023 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP1A1P05023 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP1A1P05023 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP1A1P05023 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP1A1P05023 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP1A1P05023 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP1A1P05023 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP1A1P05023 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP1A1P05023 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP1A1P05023 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP1A1P05023 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP1A1P05023 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP1A1P05023 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP1A1P05023 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP1A1P05023 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP1A1P05023 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP1A1P05023 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP1A1P05023 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP1A1P05023 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP1A1P05023 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP1A1P05023 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP1A1P05023 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP1A1P05023 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP1A1P05023 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP1A1P05023 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP1A1P05023 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP1A1P05023 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP1A1P05023 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP1A1P05023 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP1A1P05023 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP1A1P05023 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATP1A1P05023 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP1A1P05023 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP1A1P05023 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP1A1P05023 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP1A1P05023 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP1A1P05023 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP1A1P05023 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP1A1P05023 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP1A1P05023 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP1A1P05023 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP1A1P05023 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP1A1P05023 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP1A1P05023 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP1A1P05023 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP1A1P05023 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP1A1P05023 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP1A1P05023 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP1A1P05023 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP1A1P05023 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP1A1P05023 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP1A1P05023 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP1A1P05023 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP1A1P05023 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP1A1P05023 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP1A1P05023 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP1A1P05023 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP1A1P05023 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP1A1P05023 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP1A1P05023 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP1A1P05023 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP1A1P05023 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP1A1P05023 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP1A1P05023 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP1A1P05023 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP1A1P05023 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP1A1P05023 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP1A1P05023 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP1A1P05023 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP1A1P05023 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP1A1P05023 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP1A1P05023 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP1A1P05023 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP1A1P05023 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP1A1P05023 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP1A1P05023 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP1A1P05023 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP1A1P05023 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP1A1P05023 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP1A1P05023 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP1A1P05023 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP1A1P05023 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP1A1P05023 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP1A1P05023 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP1A1P05023 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP1A1P05023 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP1A1P05023 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP1A1P05023 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP1A1P05023 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP1A1P05023 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP1A1P05023 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP1A1P05023 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP1A1P05023 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP1A1P05023 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP1A1P05023 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP1A1P05023 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.9 ms