Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-DQB1P01920 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-DQB1P01920 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-DQB1P01920 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DQB1P01920 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DQB1P01920 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DQB1P01920 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DQB1P01920 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DQB1P01920 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DQB1P01920 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DQB1P01920 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DQB1P01920 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DQB1P01920 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DQB1P01920 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DQB1P01920 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DQB1P01920 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DQB1P01920 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DQB1P01920 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DQB1P01920 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DQB1P01920 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HLA-DQB1P01920 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-DQB1P01920 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-DQB1P01920 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-DQB1P01920 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-DQB1P01920 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-DQB1P01920 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-DQB1P01920 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-DQB1P01920 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-DQB1P01920 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-DQB1P01920 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-DQB1P01920 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-DQB1P01920 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-DQB1P01920 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-DQB1P01920 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-DQB1P01920 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-DQB1P01920 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-DQB1P01920 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-DQB1P01920 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-DQB1P01920 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-DQB1P01920 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-DQB1P01920 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-DQB1P01920 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-DQB1P01920 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-DQB1P01920 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-DQB1P01920 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-DQB1P01920 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-DQB1P01920 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-DQB1P01920 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-DQB1P01920 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-DQB1P01920 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-DQB1P01920 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-DQB1P01920 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-DQB1P01920 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-DQB1P01920 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-DQB1P01920 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-DQB1P01920 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HLA-DQB1P01920 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
HLA-DQB1P01920 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HLA-DQB1P01920 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-DQB1P01920 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-DQB1P01920 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-DQB1P01920 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-DQB1P01920 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-DQB1P01920 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-DQB1P01920 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-DQB1P01920 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-DQB1P01920 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-DQB1P01920 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-DQB1P01920 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-DQB1P01920 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-DQB1P01920 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-DQB1P01920 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-DQB1P01920 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-DQB1P01920 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-DQB1P01920 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-DQB1P01920 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-DQB1P01920 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-DQB1P01920 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-DQB1P01920 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-DQB1P01920 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-DQB1P01920 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HLA-DQB1P01920 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HLA-DQB1P01920 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HLA-DQB1P01920 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HLA-DQB1P01920 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HLA-DQB1P01920 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HLA-DQB1P01920 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HLA-DQB1P01920 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HLA-DQB1P01920 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HLA-DQB1P01920 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HLA-DQB1P01920 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
HLA-DQB1P01920 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HLA-DQB1P01920 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HLA-DQB1P01920 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HLA-DQB1P01920 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-DQB1P01920 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-DQB1P01920 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-DQB1P01920 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-DQB1P01920 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-DQB1P01920 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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