Protein–RNA interactions for Protein: P00736

C1R, Complement C1r subcomponent, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1RP00736 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
C1RP00736 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
C1RP00736 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C1RP00736 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C1RP00736 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
C1RP00736 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C1RP00736 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
C1RP00736 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
C1RP00736 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
C1RP00736 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
C1RP00736 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
C1RP00736 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
C1RP00736 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
C1RP00736 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C1RP00736 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
C1RP00736 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
C1RP00736 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C1RP00736 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
C1RP00736 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C1RP00736 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
C1RP00736 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
C1RP00736 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
C1RP00736 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C1RP00736 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
C1RP00736 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
C1RP00736 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
C1RP00736 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C1RP00736 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
C1RP00736 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
C1RP00736 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
C1RP00736 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C1RP00736 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C1RP00736 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C1RP00736 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C1RP00736 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
C1RP00736 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
C1RP00736 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C1RP00736 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C1RP00736 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C1RP00736 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C1RP00736 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
C1RP00736 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C1RP00736 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C1RP00736 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
C1RP00736 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
C1RP00736 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
C1RP00736 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
C1RP00736 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C1RP00736 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
C1RP00736 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
C1RP00736 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
C1RP00736 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C1RP00736 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C1RP00736 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
C1RP00736 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C1RP00736 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C1RP00736 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C1RP00736 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C1RP00736 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C1RP00736 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C1RP00736 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C1RP00736 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C1RP00736 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
C1RP00736 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
C1RP00736 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C1RP00736 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
C1RP00736 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
C1RP00736 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
C1RP00736 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
C1RP00736 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
C1RP00736 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
C1RP00736 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
C1RP00736 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
C1RP00736 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
C1RP00736 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
C1RP00736 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C1RP00736 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C1RP00736 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C1RP00736 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C1RP00736 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C1RP00736 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
C1RP00736 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C1RP00736 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C1RP00736 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C1RP00736 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C1RP00736 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C1RP00736 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C1RP00736 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C1RP00736 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C1RP00736 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C1RP00736 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C1RP00736 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
C1RP00736 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C1RP00736 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C1RP00736 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C1RP00736 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C1RP00736 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C1RP00736 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
C1RP00736 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C1RP00736 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms