Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOP3BO95985 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOP3BO95985 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOP3BO95985 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOP3BO95985 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOP3BO95985 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOP3BO95985 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOP3BO95985 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOP3BO95985 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOP3BO95985 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOP3BO95985 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOP3BO95985 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOP3BO95985 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOP3BO95985 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOP3BO95985 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOP3BO95985 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOP3BO95985 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOP3BO95985 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOP3BO95985 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOP3BO95985 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOP3BO95985 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOP3BO95985 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOP3BO95985 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOP3BO95985 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOP3BO95985 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TOP3BO95985 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TOP3BO95985 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TOP3BO95985 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TOP3BO95985 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TOP3BO95985 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TOP3BO95985 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOP3BO95985 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOP3BO95985 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOP3BO95985 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOP3BO95985 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TOP3BO95985 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOP3BO95985 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOP3BO95985 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOP3BO95985 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOP3BO95985 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOP3BO95985 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOP3BO95985 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP3BO95985 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP3BO95985 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP3BO95985 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP3BO95985 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TOP3BO95985 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TOP3BO95985 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TOP3BO95985 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TOP3BO95985 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TOP3BO95985 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TOP3BO95985 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TOP3BO95985 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TOP3BO95985 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOP3BO95985 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOP3BO95985 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TOP3BO95985 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TOP3BO95985 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TOP3BO95985 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TOP3BO95985 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TOP3BO95985 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TOP3BO95985 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TOP3BO95985 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOP3BO95985 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOP3BO95985 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TOP3BO95985 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOP3BO95985 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOP3BO95985 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOP3BO95985 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOP3BO95985 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOP3BO95985 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TOP3BO95985 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOP3BO95985 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TOP3BO95985 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOP3BO95985 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOP3BO95985 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOP3BO95985 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOP3BO95985 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOP3BO95985 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOP3BO95985 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOP3BO95985 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TOP3BO95985 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TOP3BO95985 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TOP3BO95985 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TOP3BO95985 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP3BO95985 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP3BO95985 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP3BO95985 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP3BO95985 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP3BO95985 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOP3BO95985 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOP3BO95985 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOP3BO95985 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOP3BO95985 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOP3BO95985 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOP3BO95985 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TOP3BO95985 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOP3BO95985 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOP3BO95985 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOP3BO95985 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113 ms