Protein–RNA interactions for Protein: O95755

RAB36, Ras-related protein Rab-36, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB36O95755 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB36O95755 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB36O95755 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB36O95755 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB36O95755 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB36O95755 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB36O95755 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB36O95755 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB36O95755 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB36O95755 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB36O95755 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB36O95755 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB36O95755 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB36O95755 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB36O95755 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB36O95755 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB36O95755 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB36O95755 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB36O95755 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB36O95755 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB36O95755 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB36O95755 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB36O95755 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB36O95755 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB36O95755 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB36O95755 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB36O95755 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB36O95755 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB36O95755 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB36O95755 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB36O95755 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB36O95755 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB36O95755 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB36O95755 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB36O95755 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB36O95755 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB36O95755 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB36O95755 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB36O95755 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB36O95755 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB36O95755 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB36O95755 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB36O95755 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB36O95755 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB36O95755 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB36O95755 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB36O95755 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB36O95755 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB36O95755 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB36O95755 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB36O95755 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB36O95755 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB36O95755 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB36O95755 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB36O95755 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB36O95755 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB36O95755 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB36O95755 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB36O95755 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB36O95755 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB36O95755 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB36O95755 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB36O95755 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB36O95755 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB36O95755 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB36O95755 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB36O95755 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB36O95755 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB36O95755 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB36O95755 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB36O95755 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB36O95755 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB36O95755 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB36O95755 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB36O95755 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB36O95755 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB36O95755 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB36O95755 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB36O95755 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB36O95755 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB36O95755 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB36O95755 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB36O95755 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB36O95755 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB36O95755 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB36O95755 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB36O95755 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB36O95755 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB36O95755 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB36O95755 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB36O95755 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB36O95755 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB36O95755 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB36O95755 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RAB36O95755 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB36O95755 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB36O95755 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB36O95755 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB36O95755 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB36O95755 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms