Protein–RNA interactions for Protein: O95343

SIX3, Homeobox protein SIX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3O95343 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SIX3O95343 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SIX3O95343 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SIX3O95343 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIX3O95343 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIX3O95343 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIX3O95343 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIX3O95343 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SIX3O95343 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIX3O95343 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIX3O95343 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIX3O95343 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIX3O95343 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIX3O95343 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIX3O95343 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIX3O95343 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIX3O95343 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIX3O95343 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIX3O95343 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIX3O95343 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIX3O95343 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIX3O95343 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIX3O95343 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIX3O95343 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIX3O95343 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIX3O95343 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIX3O95343 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIX3O95343 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIX3O95343 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIX3O95343 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIX3O95343 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIX3O95343 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SIX3O95343 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SIX3O95343 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SIX3O95343 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SIX3O95343 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIX3O95343 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIX3O95343 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIX3O95343 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIX3O95343 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIX3O95343 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIX3O95343 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIX3O95343 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIX3O95343 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIX3O95343 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIX3O95343 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIX3O95343 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIX3O95343 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIX3O95343 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIX3O95343 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIX3O95343 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIX3O95343 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SIX3O95343 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIX3O95343 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIX3O95343 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIX3O95343 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIX3O95343 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIX3O95343 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIX3O95343 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIX3O95343 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIX3O95343 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIX3O95343 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIX3O95343 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIX3O95343 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIX3O95343 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIX3O95343 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIX3O95343 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIX3O95343 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIX3O95343 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIX3O95343 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIX3O95343 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIX3O95343 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIX3O95343 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIX3O95343 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIX3O95343 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIX3O95343 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIX3O95343 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIX3O95343 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIX3O95343 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SIX3O95343 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIX3O95343 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIX3O95343 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIX3O95343 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SIX3O95343 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIX3O95343 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIX3O95343 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIX3O95343 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIX3O95343 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIX3O95343 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SIX3O95343 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIX3O95343 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIX3O95343 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIX3O95343 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SIX3O95343 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIX3O95343 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIX3O95343 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIX3O95343 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIX3O95343 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIX3O95343 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SIX3O95343 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms