Protein–RNA interactions for Protein: O95178

NDUFB2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFB2O95178 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFB2O95178 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFB2O95178 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFB2O95178 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFB2O95178 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFB2O95178 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFB2O95178 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFB2O95178 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFB2O95178 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFB2O95178 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFB2O95178 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFB2O95178 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFB2O95178 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFB2O95178 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFB2O95178 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFB2O95178 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFB2O95178 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFB2O95178 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFB2O95178 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFB2O95178 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFB2O95178 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFB2O95178 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFB2O95178 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFB2O95178 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFB2O95178 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFB2O95178 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFB2O95178 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFB2O95178 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFB2O95178 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFB2O95178 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFB2O95178 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFB2O95178 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFB2O95178 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFB2O95178 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFB2O95178 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFB2O95178 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFB2O95178 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFB2O95178 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFB2O95178 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFB2O95178 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFB2O95178 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFB2O95178 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFB2O95178 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFB2O95178 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFB2O95178 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFB2O95178 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFB2O95178 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFB2O95178 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFB2O95178 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFB2O95178 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFB2O95178 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFB2O95178 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFB2O95178 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFB2O95178 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFB2O95178 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFB2O95178 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFB2O95178 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFB2O95178 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFB2O95178 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFB2O95178 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFB2O95178 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFB2O95178 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFB2O95178 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFB2O95178 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFB2O95178 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFB2O95178 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFB2O95178 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFB2O95178 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFB2O95178 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NDUFB2O95178 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFB2O95178 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFB2O95178 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFB2O95178 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFB2O95178 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFB2O95178 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFB2O95178 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFB2O95178 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFB2O95178 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFB2O95178 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFB2O95178 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFB2O95178 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFB2O95178 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFB2O95178 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFB2O95178 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFB2O95178 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFB2O95178 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFB2O95178 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFB2O95178 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFB2O95178 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFB2O95178 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFB2O95178 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFB2O95178 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFB2O95178 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFB2O95178 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFB2O95178 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFB2O95178 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFB2O95178 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFB2O95178 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFB2O95178 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFB2O95178 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms