Protein–RNA interactions for Protein: O75309

CDH16, Cadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH16O75309 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH16O75309 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH16O75309 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH16O75309 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH16O75309 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH16O75309 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH16O75309 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH16O75309 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH16O75309 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH16O75309 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH16O75309 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH16O75309 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH16O75309 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH16O75309 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH16O75309 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH16O75309 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH16O75309 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH16O75309 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH16O75309 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH16O75309 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH16O75309 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH16O75309 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH16O75309 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH16O75309 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH16O75309 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH16O75309 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH16O75309 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH16O75309 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH16O75309 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH16O75309 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH16O75309 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH16O75309 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH16O75309 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH16O75309 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH16O75309 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH16O75309 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH16O75309 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH16O75309 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH16O75309 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH16O75309 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH16O75309 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH16O75309 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH16O75309 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH16O75309 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH16O75309 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH16O75309 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH16O75309 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH16O75309 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH16O75309 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH16O75309 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH16O75309 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDH16O75309 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH16O75309 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH16O75309 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH16O75309 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH16O75309 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH16O75309 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH16O75309 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH16O75309 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH16O75309 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH16O75309 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH16O75309 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH16O75309 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH16O75309 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH16O75309 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH16O75309 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH16O75309 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH16O75309 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH16O75309 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH16O75309 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH16O75309 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH16O75309 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH16O75309 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH16O75309 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH16O75309 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH16O75309 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH16O75309 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH16O75309 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH16O75309 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH16O75309 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH16O75309 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH16O75309 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH16O75309 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH16O75309 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH16O75309 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH16O75309 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH16O75309 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH16O75309 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH16O75309 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH16O75309 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH16O75309 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH16O75309 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDH16O75309 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDH16O75309 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDH16O75309 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDH16O75309 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH16O75309 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH16O75309 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH16O75309 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH16O75309 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms