Protein–RNA interactions for Protein: O75030

MITF, Microphthalmia-associated transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITFO75030 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MITFO75030 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MITFO75030 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MITFO75030 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MITFO75030 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MITFO75030 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MITFO75030 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MITFO75030 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MITFO75030 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MITFO75030 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MITFO75030 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MITFO75030 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MITFO75030 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MITFO75030 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MITFO75030 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MITFO75030 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MITFO75030 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MITFO75030 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MITFO75030 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MITFO75030 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MITFO75030 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MITFO75030 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MITFO75030 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MITFO75030 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MITFO75030 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MITFO75030 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MITFO75030 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MITFO75030 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MITFO75030 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MITFO75030 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MITFO75030 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MITFO75030 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MITFO75030 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MITFO75030 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MITFO75030 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MITFO75030 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MITFO75030 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MITFO75030 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MITFO75030 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MITFO75030 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MITFO75030 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MITFO75030 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MITFO75030 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MITFO75030 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MITFO75030 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MITFO75030 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MITFO75030 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MITFO75030 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MITFO75030 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MITFO75030 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MITFO75030 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MITFO75030 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MITFO75030 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MITFO75030 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MITFO75030 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MITFO75030 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MITFO75030 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MITFO75030 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MITFO75030 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MITFO75030 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MITFO75030 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MITFO75030 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MITFO75030 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MITFO75030 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MITFO75030 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MITFO75030 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MITFO75030 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MITFO75030 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MITFO75030 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MITFO75030 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MITFO75030 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MITFO75030 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MITFO75030 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MITFO75030 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MITFO75030 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MITFO75030 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MITFO75030 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MITFO75030 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MITFO75030 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MITFO75030 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MITFO75030 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MITFO75030 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MITFO75030 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MITFO75030 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MITFO75030 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MITFO75030 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MITFO75030 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MITFO75030 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MITFO75030 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MITFO75030 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MITFO75030 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MITFO75030 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MITFO75030 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MITFO75030 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MITFO75030 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MITFO75030 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MITFO75030 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MITFO75030 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MITFO75030 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MITFO75030 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms