Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN2BO60939 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN2BO60939 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN2BO60939 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN2BO60939 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN2BO60939 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN2BO60939 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN2BO60939 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN2BO60939 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN2BO60939 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN2BO60939 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN2BO60939 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN2BO60939 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN2BO60939 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN2BO60939 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN2BO60939 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN2BO60939 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN2BO60939 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN2BO60939 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN2BO60939 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN2BO60939 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN2BO60939 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN2BO60939 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN2BO60939 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN2BO60939 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN2BO60939 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCN2BO60939 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN2BO60939 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN2BO60939 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN2BO60939 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN2BO60939 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN2BO60939 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN2BO60939 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN2BO60939 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN2BO60939 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN2BO60939 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN2BO60939 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN2BO60939 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN2BO60939 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN2BO60939 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN2BO60939 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN2BO60939 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN2BO60939 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN2BO60939 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN2BO60939 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN2BO60939 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN2BO60939 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN2BO60939 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN2BO60939 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN2BO60939 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN2BO60939 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN2BO60939 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN2BO60939 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN2BO60939 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN2BO60939 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN2BO60939 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN2BO60939 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN2BO60939 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN2BO60939 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN2BO60939 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN2BO60939 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN2BO60939 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN2BO60939 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN2BO60939 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN2BO60939 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN2BO60939 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN2BO60939 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN2BO60939 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN2BO60939 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN2BO60939 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN2BO60939 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN2BO60939 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN2BO60939 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN2BO60939 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN2BO60939 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN2BO60939 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN2BO60939 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN2BO60939 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN2BO60939 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SCN2BO60939 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN2BO60939 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN2BO60939 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN2BO60939 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN2BO60939 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN2BO60939 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN2BO60939 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN2BO60939 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN2BO60939 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN2BO60939 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN2BO60939 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN2BO60939 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN2BO60939 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN2BO60939 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN2BO60939 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN2BO60939 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN2BO60939 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN2BO60939 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN2BO60939 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN2BO60939 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN2BO60939 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms