Protein–RNA interactions for Protein: O60635

TSPAN1, Tetraspanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN1O60635 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TSPAN1O60635 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSPAN1O60635 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSPAN1O60635 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSPAN1O60635 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSPAN1O60635 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSPAN1O60635 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSPAN1O60635 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSPAN1O60635 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSPAN1O60635 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSPAN1O60635 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TSPAN1O60635 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TSPAN1O60635 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TSPAN1O60635 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TSPAN1O60635 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSPAN1O60635 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSPAN1O60635 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSPAN1O60635 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSPAN1O60635 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSPAN1O60635 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSPAN1O60635 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TSPAN1O60635 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSPAN1O60635 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSPAN1O60635 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSPAN1O60635 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TSPAN1O60635 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TSPAN1O60635 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TSPAN1O60635 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TSPAN1O60635 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TSPAN1O60635 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TSPAN1O60635 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TSPAN1O60635 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TSPAN1O60635 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TSPAN1O60635 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TSPAN1O60635 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TSPAN1O60635 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TSPAN1O60635 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TSPAN1O60635 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TSPAN1O60635 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TSPAN1O60635 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TSPAN1O60635 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TSPAN1O60635 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TSPAN1O60635 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TSPAN1O60635 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TSPAN1O60635 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TSPAN1O60635 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TSPAN1O60635 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TSPAN1O60635 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TSPAN1O60635 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSPAN1O60635 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TSPAN1O60635 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSPAN1O60635 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSPAN1O60635 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSPAN1O60635 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSPAN1O60635 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TSPAN1O60635 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSPAN1O60635 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSPAN1O60635 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSPAN1O60635 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TSPAN1O60635 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TSPAN1O60635 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TSPAN1O60635 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TSPAN1O60635 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TSPAN1O60635 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TSPAN1O60635 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TSPAN1O60635 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TSPAN1O60635 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TSPAN1O60635 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TSPAN1O60635 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TSPAN1O60635 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TSPAN1O60635 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TSPAN1O60635 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TSPAN1O60635 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TSPAN1O60635 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TSPAN1O60635 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSPAN1O60635 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TSPAN1O60635 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSPAN1O60635 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSPAN1O60635 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSPAN1O60635 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TSPAN1O60635 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TSPAN1O60635 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TSPAN1O60635 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TSPAN1O60635 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TSPAN1O60635 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TSPAN1O60635 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TSPAN1O60635 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TSPAN1O60635 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TSPAN1O60635 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TSPAN1O60635 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TSPAN1O60635 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TSPAN1O60635 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TSPAN1O60635 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TSPAN1O60635 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TSPAN1O60635 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TSPAN1O60635 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TSPAN1O60635 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TSPAN1O60635 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TSPAN1O60635 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TSPAN1O60635 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms