Protein–RNA interactions for Protein: O60493

SNX3, Sorting nexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX3O60493 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX3O60493 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX3O60493 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX3O60493 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX3O60493 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX3O60493 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX3O60493 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX3O60493 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX3O60493 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX3O60493 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX3O60493 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX3O60493 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX3O60493 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX3O60493 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX3O60493 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX3O60493 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX3O60493 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX3O60493 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX3O60493 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX3O60493 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX3O60493 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX3O60493 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX3O60493 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX3O60493 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX3O60493 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX3O60493 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX3O60493 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX3O60493 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX3O60493 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX3O60493 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX3O60493 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX3O60493 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX3O60493 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX3O60493 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX3O60493 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX3O60493 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX3O60493 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX3O60493 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX3O60493 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX3O60493 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX3O60493 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX3O60493 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX3O60493 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX3O60493 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX3O60493 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX3O60493 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX3O60493 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX3O60493 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX3O60493 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX3O60493 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX3O60493 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX3O60493 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX3O60493 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX3O60493 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX3O60493 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX3O60493 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SNX3O60493 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX3O60493 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX3O60493 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX3O60493 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX3O60493 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX3O60493 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX3O60493 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX3O60493 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX3O60493 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX3O60493 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX3O60493 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX3O60493 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX3O60493 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX3O60493 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX3O60493 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX3O60493 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX3O60493 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX3O60493 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX3O60493 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX3O60493 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX3O60493 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX3O60493 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX3O60493 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX3O60493 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX3O60493 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX3O60493 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX3O60493 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX3O60493 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX3O60493 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX3O60493 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX3O60493 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX3O60493 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX3O60493 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX3O60493 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX3O60493 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX3O60493 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX3O60493 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX3O60493 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX3O60493 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX3O60493 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX3O60493 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX3O60493 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX3O60493 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX3O60493 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms