Protein–RNA interactions for Protein: O43790

KRT86, Keratin, type II cuticular Hb6, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT86O43790 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT86O43790 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT86O43790 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT86O43790 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT86O43790 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT86O43790 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
KRT86O43790 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KRT86O43790 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT86O43790 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT86O43790 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT86O43790 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT86O43790 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT86O43790 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT86O43790 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT86O43790 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT86O43790 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT86O43790 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT86O43790 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT86O43790 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT86O43790 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT86O43790 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT86O43790 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT86O43790 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT86O43790 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT86O43790 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT86O43790 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT86O43790 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT86O43790 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT86O43790 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT86O43790 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT86O43790 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
KRT86O43790 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
KRT86O43790 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT86O43790 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT86O43790 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT86O43790 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT86O43790 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT86O43790 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT86O43790 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT86O43790 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT86O43790 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT86O43790 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT86O43790 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT86O43790 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT86O43790 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT86O43790 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT86O43790 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT86O43790 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT86O43790 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT86O43790 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT86O43790 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT86O43790 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT86O43790 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT86O43790 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT86O43790 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT86O43790 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT86O43790 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT86O43790 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT86O43790 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT86O43790 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT86O43790 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT86O43790 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT86O43790 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT86O43790 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT86O43790 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT86O43790 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT86O43790 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT86O43790 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT86O43790 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT86O43790 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT86O43790 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT86O43790 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT86O43790 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT86O43790 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT86O43790 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT86O43790 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT86O43790 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT86O43790 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT86O43790 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT86O43790 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT86O43790 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT86O43790 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT86O43790 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT86O43790 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT86O43790 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT86O43790 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT86O43790 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT86O43790 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT86O43790 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT86O43790 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT86O43790 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT86O43790 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT86O43790 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT86O43790 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT86O43790 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT86O43790 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT86O43790 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT86O43790 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT86O43790 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
KRT86O43790 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms