Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
HTATSF1O43719 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
HTATSF1O43719 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
HTATSF1O43719 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
HTATSF1O43719 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
HTATSF1O43719 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
HTATSF1O43719 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
HTATSF1O43719 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
HTATSF1O43719 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
HTATSF1O43719 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
HTATSF1O43719 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
HTATSF1O43719 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC32.43■■■□□ 2.78
HTATSF1O43719 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
HTATSF1O43719 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
HTATSF1O43719 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
HTATSF1O43719 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
HTATSF1O43719 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
HTATSF1O43719 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
HTATSF1O43719 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
HTATSF1O43719 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
HTATSF1O43719 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
HTATSF1O43719 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
HTATSF1O43719 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
HTATSF1O43719 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
HTATSF1O43719 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
HTATSF1O43719 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
HTATSF1O43719 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
HTATSF1O43719 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
HTATSF1O43719 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
HTATSF1O43719 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
HTATSF1O43719 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
HTATSF1O43719 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
HTATSF1O43719 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
HTATSF1O43719 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
HTATSF1O43719 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
HTATSF1O43719 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
HTATSF1O43719 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
HTATSF1O43719 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
HTATSF1O43719 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
HTATSF1O43719 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
HTATSF1O43719 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
HTATSF1O43719 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
HTATSF1O43719 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
HTATSF1O43719 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
HTATSF1O43719 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
HTATSF1O43719 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
HTATSF1O43719 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
HTATSF1O43719 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
HTATSF1O43719 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
HTATSF1O43719 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
HTATSF1O43719 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.77
HTATSF1O43719 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
HTATSF1O43719 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
HTATSF1O43719 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
HTATSF1O43719 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
HTATSF1O43719 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
HTATSF1O43719 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
HTATSF1O43719 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
HTATSF1O43719 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
HTATSF1O43719 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
HTATSF1O43719 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
HTATSF1O43719 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
HTATSF1O43719 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
HTATSF1O43719 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
HTATSF1O43719 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
HTATSF1O43719 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
HTATSF1O43719 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC32.28■■■□□ 2.76
HTATSF1O43719 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
HTATSF1O43719 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
HTATSF1O43719 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
HTATSF1O43719 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
HTATSF1O43719 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
HTATSF1O43719 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
HTATSF1O43719 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
HTATSF1O43719 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
HTATSF1O43719 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
HTATSF1O43719 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
HTATSF1O43719 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
HTATSF1O43719 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
HTATSF1O43719 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
HTATSF1O43719 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
HTATSF1O43719 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
HTATSF1O43719 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
HTATSF1O43719 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
HTATSF1O43719 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
HTATSF1O43719 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
HTATSF1O43719 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
HTATSF1O43719 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
HTATSF1O43719 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
HTATSF1O43719 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
HTATSF1O43719 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
HTATSF1O43719 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
HTATSF1O43719 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
HTATSF1O43719 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
HTATSF1O43719 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
HTATSF1O43719 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
HTATSF1O43719 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
HTATSF1O43719 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
HTATSF1O43719 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
HTATSF1O43719 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
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