Protein–RNA interactions for Protein: O43374

RASA4, Ras GTPase-activating protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA4O43374 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RASA4O43374 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RASA4O43374 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RASA4O43374 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RASA4O43374 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RASA4O43374 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RASA4O43374 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RASA4O43374 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RASA4O43374 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RASA4O43374 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RASA4O43374 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RASA4O43374 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RASA4O43374 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RASA4O43374 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RASA4O43374 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RASA4O43374 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RASA4O43374 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RASA4O43374 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RASA4O43374 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RASA4O43374 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RASA4O43374 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RASA4O43374 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RASA4O43374 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RASA4O43374 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RASA4O43374 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RASA4O43374 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RASA4O43374 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RASA4O43374 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RASA4O43374 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RASA4O43374 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RASA4O43374 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RASA4O43374 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RASA4O43374 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RASA4O43374 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RASA4O43374 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RASA4O43374 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RASA4O43374 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RASA4O43374 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RASA4O43374 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RASA4O43374 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
RASA4O43374 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RASA4O43374 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RASA4O43374 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
RASA4O43374 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RASA4O43374 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RASA4O43374 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RASA4O43374 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RASA4O43374 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RASA4O43374 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RASA4O43374 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RASA4O43374 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RASA4O43374 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RASA4O43374 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RASA4O43374 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RASA4O43374 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RASA4O43374 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RASA4O43374 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RASA4O43374 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RASA4O43374 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RASA4O43374 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RASA4O43374 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RASA4O43374 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RASA4O43374 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RASA4O43374 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RASA4O43374 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RASA4O43374 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RASA4O43374 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RASA4O43374 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RASA4O43374 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RASA4O43374 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RASA4O43374 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RASA4O43374 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RASA4O43374 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RASA4O43374 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RASA4O43374 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RASA4O43374 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RASA4O43374 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RASA4O43374 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RASA4O43374 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RASA4O43374 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RASA4O43374 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RASA4O43374 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RASA4O43374 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RASA4O43374 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RASA4O43374 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RASA4O43374 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RASA4O43374 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RASA4O43374 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RASA4O43374 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RASA4O43374 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RASA4O43374 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RASA4O43374 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RASA4O43374 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RASA4O43374 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RASA4O43374 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RASA4O43374 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RASA4O43374 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RASA4O43374 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RASA4O43374 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RASA4O43374 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms