Protein–RNA interactions for Protein: O43323

DHH, Desert hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHHO43323 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DHHO43323 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DHHO43323 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DHHO43323 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DHHO43323 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DHHO43323 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DHHO43323 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DHHO43323 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DHHO43323 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DHHO43323 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DHHO43323 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DHHO43323 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DHHO43323 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DHHO43323 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DHHO43323 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DHHO43323 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DHHO43323 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHHO43323 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHHO43323 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHHO43323 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHHO43323 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DHHO43323 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DHHO43323 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DHHO43323 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DHHO43323 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DHHO43323 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DHHO43323 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DHHO43323 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DHHO43323 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DHHO43323 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DHHO43323 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DHHO43323 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DHHO43323 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DHHO43323 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DHHO43323 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DHHO43323 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DHHO43323 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DHHO43323 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DHHO43323 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DHHO43323 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DHHO43323 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DHHO43323 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DHHO43323 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DHHO43323 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DHHO43323 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DHHO43323 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DHHO43323 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DHHO43323 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
DHHO43323 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DHHO43323 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DHHO43323 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DHHO43323 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DHHO43323 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DHHO43323 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DHHO43323 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DHHO43323 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DHHO43323 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DHHO43323 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DHHO43323 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
DHHO43323 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DHHO43323 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DHHO43323 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DHHO43323 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DHHO43323 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DHHO43323 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DHHO43323 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DHHO43323 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DHHO43323 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DHHO43323 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DHHO43323 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DHHO43323 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DHHO43323 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
DHHO43323 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
DHHO43323 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DHHO43323 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DHHO43323 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DHHO43323 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DHHO43323 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DHHO43323 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DHHO43323 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DHHO43323 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DHHO43323 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DHHO43323 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DHHO43323 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DHHO43323 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DHHO43323 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DHHO43323 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DHHO43323 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DHHO43323 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DHHO43323 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DHHO43323 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DHHO43323 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DHHO43323 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DHHO43323 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DHHO43323 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DHHO43323 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DHHO43323 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DHHO43323 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DHHO43323 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DHHO43323 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms