Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCP110O43303 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCP110O43303 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CCP110O43303 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCP110O43303 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCP110O43303 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCP110O43303 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCP110O43303 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCP110O43303 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCP110O43303 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCP110O43303 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCP110O43303 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCP110O43303 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCP110O43303 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCP110O43303 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCP110O43303 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCP110O43303 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCP110O43303 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCP110O43303 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCP110O43303 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCP110O43303 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCP110O43303 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCP110O43303 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCP110O43303 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCP110O43303 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCP110O43303 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCP110O43303 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCP110O43303 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCP110O43303 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCP110O43303 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCP110O43303 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCP110O43303 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCP110O43303 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCP110O43303 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCP110O43303 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCP110O43303 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCP110O43303 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCP110O43303 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCP110O43303 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCP110O43303 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCP110O43303 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCP110O43303 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCP110O43303 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCP110O43303 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCP110O43303 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCP110O43303 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCP110O43303 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCP110O43303 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCP110O43303 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCP110O43303 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCP110O43303 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCP110O43303 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCP110O43303 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCP110O43303 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCP110O43303 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCP110O43303 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCP110O43303 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CCP110O43303 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCP110O43303 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CCP110O43303 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCP110O43303 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCP110O43303 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCP110O43303 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCP110O43303 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCP110O43303 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCP110O43303 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCP110O43303 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCP110O43303 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCP110O43303 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCP110O43303 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CCP110O43303 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCP110O43303 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CCP110O43303 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCP110O43303 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCP110O43303 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCP110O43303 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCP110O43303 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCP110O43303 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCP110O43303 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCP110O43303 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCP110O43303 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCP110O43303 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCP110O43303 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCP110O43303 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCP110O43303 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCP110O43303 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCP110O43303 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCP110O43303 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCP110O43303 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CCP110O43303 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCP110O43303 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCP110O43303 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCP110O43303 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCP110O43303 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CCP110O43303 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCP110O43303 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCP110O43303 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCP110O43303 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCP110O43303 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCP110O43303 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.2 ms