Protein–RNA interactions for Protein: O15534

PER1, Period circadian protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PER1O15534 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PER1O15534 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PER1O15534 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PER1O15534 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PER1O15534 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PER1O15534 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
PER1O15534 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PER1O15534 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PER1O15534 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
PER1O15534 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PER1O15534 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
PER1O15534 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PER1O15534 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC34■■■■□ 3.03
PER1O15534 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
PER1O15534 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PER1O15534 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PER1O15534 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PER1O15534 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PER1O15534 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PER1O15534 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PER1O15534 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
PER1O15534 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PER1O15534 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PER1O15534 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PER1O15534 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PER1O15534 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PER1O15534 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
PER1O15534 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
PER1O15534 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PER1O15534 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PER1O15534 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PER1O15534 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PER1O15534 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PER1O15534 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PER1O15534 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PER1O15534 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
PER1O15534 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PER1O15534 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PER1O15534 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PER1O15534 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PER1O15534 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PER1O15534 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
PER1O15534 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PER1O15534 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PER1O15534 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PER1O15534 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PER1O15534 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PER1O15534 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PER1O15534 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PER1O15534 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PER1O15534 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PER1O15534 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
PER1O15534 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PER1O15534 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PER1O15534 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PER1O15534 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PER1O15534 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PER1O15534 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PER1O15534 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PER1O15534 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PER1O15534 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PER1O15534 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PER1O15534 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PER1O15534 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PER1O15534 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PER1O15534 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PER1O15534 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PER1O15534 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PER1O15534 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PER1O15534 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PER1O15534 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PER1O15534 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PER1O15534 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PER1O15534 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
PER1O15534 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PER1O15534 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PER1O15534 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PER1O15534 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PER1O15534 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
PER1O15534 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
PER1O15534 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PER1O15534 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PER1O15534 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
PER1O15534 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC33.8■■■■□ 3
PER1O15534 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PER1O15534 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PER1O15534 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC33.79■■■■□ 3
PER1O15534 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PER1O15534 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
PER1O15534 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
PER1O15534 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC33.79■■■■□ 3
PER1O15534 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PER1O15534 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
PER1O15534 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PER1O15534 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
PER1O15534 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PER1O15534 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PER1O15534 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PER1O15534 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PER1O15534 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms