Protein–RNA interactions for Protein: O15533

TAPBP, Tapasin, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAPBPO15533 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAPBPO15533 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAPBPO15533 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAPBPO15533 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAPBPO15533 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAPBPO15533 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAPBPO15533 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAPBPO15533 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAPBPO15533 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAPBPO15533 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TAPBPO15533 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TAPBPO15533 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAPBPO15533 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAPBPO15533 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TAPBPO15533 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAPBPO15533 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TAPBPO15533 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAPBPO15533 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAPBPO15533 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAPBPO15533 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAPBPO15533 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAPBPO15533 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAPBPO15533 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAPBPO15533 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAPBPO15533 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAPBPO15533 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAPBPO15533 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAPBPO15533 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAPBPO15533 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAPBPO15533 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAPBPO15533 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TAPBPO15533 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAPBPO15533 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAPBPO15533 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAPBPO15533 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAPBPO15533 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAPBPO15533 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAPBPO15533 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAPBPO15533 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAPBPO15533 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAPBPO15533 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TAPBPO15533 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAPBPO15533 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TAPBPO15533 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAPBPO15533 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAPBPO15533 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAPBPO15533 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAPBPO15533 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TAPBPO15533 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TAPBPO15533 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAPBPO15533 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAPBPO15533 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAPBPO15533 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAPBPO15533 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAPBPO15533 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAPBPO15533 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAPBPO15533 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAPBPO15533 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAPBPO15533 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAPBPO15533 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAPBPO15533 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TAPBPO15533 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TAPBPO15533 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TAPBPO15533 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TAPBPO15533 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAPBPO15533 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAPBPO15533 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAPBPO15533 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAPBPO15533 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAPBPO15533 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAPBPO15533 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAPBPO15533 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TAPBPO15533 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TAPBPO15533 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TAPBPO15533 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TAPBPO15533 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TAPBPO15533 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TAPBPO15533 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TAPBPO15533 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAPBPO15533 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAPBPO15533 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAPBPO15533 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAPBPO15533 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAPBPO15533 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAPBPO15533 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAPBPO15533 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TAPBPO15533 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TAPBPO15533 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TAPBPO15533 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TAPBPO15533 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAPBPO15533 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAPBPO15533 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAPBPO15533 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAPBPO15533 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAPBPO15533 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TAPBPO15533 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAPBPO15533 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAPBPO15533 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAPBPO15533 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAPBPO15533 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms