Protein–RNA interactions for Protein: O00116

AGPS, Alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, peroxisomal, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPSO00116 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AGPSO00116 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AGPSO00116 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AGPSO00116 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AGPSO00116 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AGPSO00116 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AGPSO00116 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGPSO00116 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGPSO00116 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGPSO00116 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
AGPSO00116 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AGPSO00116 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AGPSO00116 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AGPSO00116 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AGPSO00116 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AGPSO00116 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AGPSO00116 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
AGPSO00116 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AGPSO00116 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AGPSO00116 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AGPSO00116 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AGPSO00116 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AGPSO00116 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AGPSO00116 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AGPSO00116 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AGPSO00116 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
AGPSO00116 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AGPSO00116 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AGPSO00116 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AGPSO00116 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AGPSO00116 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AGPSO00116 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AGPSO00116 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AGPSO00116 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AGPSO00116 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AGPSO00116 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AGPSO00116 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AGPSO00116 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AGPSO00116 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AGPSO00116 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AGPSO00116 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AGPSO00116 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AGPSO00116 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AGPSO00116 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AGPSO00116 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AGPSO00116 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AGPSO00116 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
AGPSO00116 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AGPSO00116 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AGPSO00116 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AGPSO00116 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
AGPSO00116 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
AGPSO00116 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AGPSO00116 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AGPSO00116 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AGPSO00116 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AGPSO00116 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AGPSO00116 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AGPSO00116 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
AGPSO00116 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AGPSO00116 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AGPSO00116 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AGPSO00116 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AGPSO00116 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AGPSO00116 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AGPSO00116 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AGPSO00116 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AGPSO00116 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AGPSO00116 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AGPSO00116 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AGPSO00116 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
AGPSO00116 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AGPSO00116 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AGPSO00116 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
AGPSO00116 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGPSO00116 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGPSO00116 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGPSO00116 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGPSO00116 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AGPSO00116 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AGPSO00116 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AGPSO00116 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AGPSO00116 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AGPSO00116 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
AGPSO00116 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGPSO00116 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGPSO00116 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGPSO00116 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGPSO00116 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGPSO00116 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGPSO00116 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGPSO00116 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGPSO00116 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGPSO00116 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGPSO00116 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGPSO00116 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGPSO00116 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGPSO00116 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGPSO00116 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGPSO00116 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms